More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1106 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1123  putative aldehyde dehydrogenase  94.51 
 
 
475 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1106  putative aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  962    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0080  Aldehyde Dehydrogenase  84.63 
 
 
475 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2607  aldehyde Dehydrogenase  44.18 
 
 
473 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2258  aldehyde dehydrogenase  45.39 
 
 
473 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0191604  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3504  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
474 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1506  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
472 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.79 
 
 
510 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  36.66 
 
 
505 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  36.66 
 
 
505 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  36.66 
 
 
505 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  36.03 
 
 
509 aa  259  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 
512 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.71 
 
 
522 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  34.3 
 
 
521 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  32.34 
 
 
533 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.57 
 
 
551 aa  223  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 
521 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
540 aa  222  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
457 aa  217  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  34.06 
 
 
531 aa  216  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  32.32 
 
 
455 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.15 
 
 
541 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
525 aa  210  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.03 
 
 
538 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
518 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  35.68 
 
 
499 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.56 
 
 
483 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.82 
 
 
484 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  33.92 
 
 
461 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  33.63 
 
 
505 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.3 
 
 
495 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.3 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.3 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  33.72 
 
 
460 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.44 
 
 
483 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.44 
 
 
483 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  33.55 
 
 
473 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  32.89 
 
 
480 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  33.73 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.09 
 
 
483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  34.52 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.16 
 
 
480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.04 
 
 
486 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.87 
 
 
483 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.64 
 
 
489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.64 
 
 
489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.64 
 
 
489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  33.49 
 
 
461 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  31.19 
 
 
489 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.89 
 
 
486 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.42 
 
 
489 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.87 
 
 
483 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.85 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.85 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.42 
 
 
489 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  29.65 
 
 
483 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.53 
 
 
488 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.65 
 
 
483 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  29.65 
 
 
483 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.65 
 
 
483 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  30.79 
 
 
486 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.23 
 
 
480 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  31.98 
 
 
499 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  31.72 
 
 
480 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  27.84 
 
 
477 aa  193  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.62 
 
 
526 aa  192  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  31.5 
 
 
480 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  30.99 
 
 
463 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  31.96 
 
 
485 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  31.6 
 
 
469 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.9 
 
 
479 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  31.5 
 
 
480 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.09 
 
 
537 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  32.02 
 
 
494 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.12 
 
 
477 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  33.97 
 
 
468 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  30.98 
 
 
475 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.2 
 
 
483 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  30.97 
 
 
480 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  30.98 
 
 
475 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  33.57 
 
 
461 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  33.1 
 
 
483 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.69 
 
 
479 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.61 
 
 
487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  30.94 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.14 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.64 
 
 
488 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  28.98 
 
 
483 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.9 
 
 
479 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.47 
 
 
479 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.69 
 
 
479 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.47 
 
 
479 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  30.68 
 
 
510 aa  190  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.47 
 
 
479 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.69 
 
 
479 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  31.85 
 
 
503 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  30.06 
 
 
491 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
540 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  31.18 
 
 
468 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>