33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1927 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1927    100 
 
 		 273 bp  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000822278  normal  0.473378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  91.43 
 
 		 732 bp  91.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  80.86 
 
 		 732 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  92.59 
 
 		 702 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  90.16 
 
 		 705 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.16 
 
 		 732 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.16 
 
 		 735 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  90.16 
 
 		 729 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  90.16 
 
 		 729 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  90.16 
 
 		 729 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  90.16 
 
 		 729 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  90.16 
 
 		 729 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.16 
 
 		 735 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.16 
 
 		 732 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.16 
 
 		 735 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  90.16 
 
 		 729 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  88.33 
 
 		 762 bp  63.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  88.89 
 
 		 669 bp  60  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  88.89 
 
 		 669 bp  60  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  88.89 
 
 		 669 bp  60  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  89.58 
 
 		 729 bp  56  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.91 
 
 		 669 bp  56  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.91 
 
 		 669 bp  56  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.91 
 
 		 669 bp  56  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  86.21 
 
 		 789 bp  52  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.48 
 
 		 801 bp  52  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  87.04 
 
 		 732 bp  52  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  93.75 
 
 		 930 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  87.5 
 
 		 789 bp  48.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  88.64 
 
 		 669 bp  48.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  87.23 
 
 		 915 bp  46.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  93.55 
 
 		 798 bp  46.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  93.55 
 
 		 729 bp  46.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>