19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0097 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0097    100 
 
 		 1230 bp  2438    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  80.39 
 
 		 1317 bp  502  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  80.18 
 
 		 1347 bp  216  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0096    100 
 
 		 222 bp  139  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  91.38 
 
 		 1329 bp  75.8  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  80.45 
 
 		 1344 bp  69.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  86.49 
 
 		 1329 bp  67.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  86.76 
 
 		 1386 bp  63.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  85.14 
 
 		 1317 bp  60  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  84.42 
 
 		 1314 bp  58  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  82.8 
 
 		 1344 bp  58  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  87.27 
 
 		 1341 bp  54  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  94.12 
 
 		 1458 bp  52  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  81.15 
 
 		 1356 bp  52  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  96.67 
 
 		 1323 bp  52  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  91.89 
 
 		 1341 bp  50.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  86.79 
 
 		 1308 bp  50.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  81.03 
 
 		 1365 bp  48.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  91.67 
 
 		 1263 bp  48.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>