22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0087 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0087    100 
 
 
390 bp  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  90.57 
 
 
831 bp  65.9  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  82.98 
 
 
837 bp  60  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3628  alpha/beta hydrolase fold  82.98 
 
 
837 bp  60  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  88.68 
 
 
831 bp  58  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  82.8 
 
 
831 bp  58  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  88.68 
 
 
831 bp  58  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  86.67 
 
 
831 bp  56  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  96.67 
 
 
843 bp  52  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  86.79 
 
 
831 bp  50.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  96.55 
 
 
1188 bp  50.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
825 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  87.5 
 
 
822 bp  48.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
825 bp  48.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
831 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  100 
 
 
831 bp  46.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  85.45 
 
 
837 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
831 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  85.45 
 
 
837 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  85.45 
 
 
837 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  87.23 
 
 
831 bp  46.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  85.45 
 
 
837 bp  46.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>