159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0083 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0083  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  73.33 
 
 
343 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  73.33 
 
 
343 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  71.85 
 
 
342 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  71.11 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  71.85 
 
 
340 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  71.11 
 
 
340 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  70.37 
 
 
340 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  70.59 
 
 
453 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  68.38 
 
 
341 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  68.38 
 
 
341 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  67.65 
 
 
341 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  67.65 
 
 
338 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  66.91 
 
 
341 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  66.91 
 
 
341 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  66.18 
 
 
341 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  66.18 
 
 
341 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  66.18 
 
 
341 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  72.59 
 
 
343 aa  177  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  65.44 
 
 
342 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  67.65 
 
 
315 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  67.65 
 
 
339 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  66.67 
 
 
343 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  66.67 
 
 
343 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  52.99 
 
 
357 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  50.37 
 
 
334 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  51.85 
 
 
337 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  48.12 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  47.79 
 
 
329 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  48.15 
 
 
333 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  47.14 
 
 
340 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  40.3 
 
 
319 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  45.26 
 
 
339 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  43.8 
 
 
337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  41.04 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  43.26 
 
 
325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  37.58 
 
 
326 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  41.72 
 
 
364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  38.85 
 
 
356 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  49.12 
 
 
360 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  42.55 
 
 
327 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  41.72 
 
 
387 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  42.25 
 
 
340 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  44.37 
 
 
342 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  37.93 
 
 
334 aa  88.2  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2957  hypothetical protein  45.68 
 
 
111 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  45.78 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  40.91 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2510  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  62.07 
 
 
119 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433754  normal  0.363997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  40.62 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  38.89 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  40.96 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1934  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.96 
 
 
133 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0140126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  40 
 
 
306 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  39.42 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  34.71 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  41.57 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  34.95 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  41.57 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  45.68 
 
 
373 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1635  hypothetical protein  38.27 
 
 
107 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272897  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  41.38 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5314  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.5 
 
 
107 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3674  hypothetical protein  36.25 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  29.19 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0964  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  43.75 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1257  hypothetical protein  41.25 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  44.44 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5447  hypothetical protein  41.03 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.27292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1786  hypothetical protein  36.25 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0365077  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  41.98 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  36.63 
 
 
386 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0502  hypothetical protein  42.5 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  38.89 
 
 
313 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4322  protein of unknown function DUF182  35.8 
 
 
108 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  35.77 
 
 
323 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1754  protein of unknown function DUF182  41.03 
 
 
107 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2603  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0473  hypothetical protein  41.25 
 
 
110 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0459384  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  39.29 
 
 
386 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1292  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40 
 
 
112 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0353078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  39.29 
 
 
386 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  39.29 
 
 
386 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  40.51 
 
 
369 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2838  protein of unknown function DUF182  42.5 
 
 
103 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  37.35 
 
 
340 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  38.75 
 
 
342 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3470  hypothetical protein  41.03 
 
 
107 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.362357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1185  protein of unknown function DUF182  37.04 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.567555  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  44.74 
 
 
338 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  38.55 
 
 
323 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0987  protein of unknown function DUF182  37.04 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0403063  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  33.08 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6029  protein of unknown function DUF182  38.75 
 
 
109 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2201  hypothetical protein  36.25 
 
 
107 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  39.74 
 
 
357 aa  60.1  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  39.02 
 
 
398 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  44.16 
 
 
367 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  41.33 
 
 
483 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>