197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0039 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0039  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2711  YjgF family translation initiation inhibitor  64.5 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 152 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1960  hypothetical protein  41.33 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  37.67 
 
 		 156 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 152 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  39.33 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  39.33 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  41.43 
 
 		 407 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  39.72 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  40.91 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  40.41 
 
 		 153 aa  98.2  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 		 164 aa  98.2  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 153 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  38.96 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  45.07 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  36.73 
 
 		 151 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  40.27 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  33.55 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 157 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  43.92 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  38.56 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  39.01 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  36.5 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  40.29 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  36 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  37.67 
 
 		 152 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 153 aa  88.2  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  34.51 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  40.27 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  43.06 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  39.72 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  41.26 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 154 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  37.06 
 
 		 185 aa  84  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  37.06 
 
 		 185 aa  84  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5181  endoribonuclease L-PSP  38.13 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  35.17 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  35.17 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  35.17 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  38.78 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  36.36 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  30.92 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  39.16 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  39.23 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  38.16 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  39.23 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  35.1 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>