120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1842 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1842  putative cytochrome C552  100 
 
 		 111 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6318  putative cytochrome c552  88.29 
 
 		 111 aa  207  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1140  cytochrome c family protein  65.74 
 
 		 114 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0457  cytochrome c family protein  61.06 
 
 		 171 aa  142  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5907  cytochrome c, class I  63.46 
 
 		 111 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0867069  normal  0.452961 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6193  cytochrome c, class I  68.6 
 
 		 111 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.479437  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1033  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.30031  normal  0.50008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  34.23 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  38.68 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  44.59 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  44.59 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  44.59 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  44.59 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  44.59 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  44.59 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  45.33 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  36 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  38.27 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3038  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277662  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  34.26 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  31.19 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  35.11 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  32.08 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  37.37 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  37.37 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  37.37 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  34.86 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  33.01 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  30.84 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 404 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  37.11 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 348 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  38.27 
 
 		 984 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  35.06 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 800 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1565  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1962  cytochrome c family protein  35.37 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  33.75 
 
 		 1138 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1630  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000303587  hitchhiker  0.0000000150302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  29.29 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  29.91 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  30 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  29.29 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  32.93 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  40.24 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  36.14 
 
 		 360 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  30 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  33.33 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7662  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0987  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  28.83 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1476  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  32.65 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  30.49 
 
 		 909 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  32.93 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>