More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1068 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1068  Maf-like protein  100 
 
 
205 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2916  Maf-like protein  92.2 
 
 
205 aa  344  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127019  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0824  Maf-like protein  79.21 
 
 
206 aa  315  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772953  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2911  Maf-like protein  79.19 
 
 
237 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2484  Maf-like protein  79.19 
 
 
237 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0526  Maf-like protein  76.96 
 
 
215 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2857  Maf-like protein  76.96 
 
 
215 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2798  Maf-like protein  76.96 
 
 
215 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1807  Maf-like protein  76.96 
 
 
215 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2796  Maf-like protein  76.96 
 
 
215 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2187  Maf-like protein  76.1 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.165473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0637  Maf-like protein  73.27 
 
 
210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0282745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1117  Maf-like protein  73.27 
 
 
210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1075  Maf-like protein  73.76 
 
 
210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0997  Maf-like protein  73.27 
 
 
209 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0993  Maf-like protein  73.27 
 
 
209 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1713  Maf-like protein  77.55 
 
 
236 aa  268  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4229  Maf-like protein  72.77 
 
 
210 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  69.39 
 
 
199 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  69.39 
 
 
194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  67.34 
 
 
198 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  67.34 
 
 
198 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  66.33 
 
 
199 aa  227  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  61.58 
 
 
192 aa  218  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  58.91 
 
 
223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  59.7 
 
 
201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  59.9 
 
 
219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  58.33 
 
 
199 aa  205  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  59.47 
 
 
205 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  60.1 
 
 
193 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  57.81 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  60.62 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1068  maf protein  58.73 
 
 
198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204734  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0401  maf protein  59.9 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0633  hypothetical protein  59.49 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.684871  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  55.61 
 
 
193 aa  188  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  52.31 
 
 
198 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  51.79 
 
 
199 aa  184  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2637  maf protein  60.1 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3284  maf protein  60.1 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1557  Maf-like protein  58.25 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19195  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  48.97 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1872  maf protein  50.25 
 
 
197 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3264  maf protein  58 
 
 
199 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0500  maf protein  54.08 
 
 
201 aa  175  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  49.74 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  47.67 
 
 
200 aa  171  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  48.72 
 
 
194 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  55.96 
 
 
191 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  48.72 
 
 
194 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  47.67 
 
 
199 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  48.17 
 
 
194 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  48.17 
 
 
194 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  48.21 
 
 
194 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  47.18 
 
 
196 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5276  maf protein  57.73 
 
 
206 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2299  maf protein  48.76 
 
 
206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000567223  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  46.32 
 
 
198 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  46.32 
 
 
198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  46.94 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  46.94 
 
 
207 aa  164  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  46.94 
 
 
207 aa  164  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  46.94 
 
 
207 aa  164  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  46.94 
 
 
207 aa  164  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  46.94 
 
 
207 aa  164  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  46.94 
 
 
207 aa  164  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  46.94 
 
 
194 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  46.94 
 
 
194 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  49.46 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  46.32 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  46.91 
 
 
203 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  46.39 
 
 
195 aa  160  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  48.21 
 
 
194 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  48.21 
 
 
194 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2128  maf protein  45.41 
 
 
194 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2127  maf protein  43.65 
 
 
200 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0858484  normal  0.0145358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  48.19 
 
 
204 aa  158  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  49.22 
 
 
192 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  49.22 
 
 
192 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  45.41 
 
 
193 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  46.56 
 
 
194 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1597  maf protein  48.97 
 
 
198 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292492  hitchhiker  0.000898144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  48.21 
 
 
194 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  47.69 
 
 
194 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  55.56 
 
 
189 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  46.03 
 
 
194 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  41.54 
 
 
200 aa  154  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  41.62 
 
 
193 aa  154  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.32 
 
 
197 aa  154  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1900  maf protein  49.48 
 
 
206 aa  154  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000961367  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  44.44 
 
 
204 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  45.41 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1623  Maf-like protein  48.69 
 
 
193 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1493  maf protein  43.59 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000920267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2402  maf protein  45.96 
 
 
204 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000551046  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  46.77 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02914  Maf-like protein  41.45 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  44.62 
 
 
197 aa  144  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  46.81 
 
 
204 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  41.67 
 
 
193 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>