22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5361 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5361  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  850    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0691141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5425  hypothetical protein  34.3 
 
 		 451 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5030  protein of unknown function DUF1173  33.74 
 
 		 441 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6533  hypothetical protein  35.6 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5585  hypothetical protein  32.9 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6249  hypothetical protein  33.95 
 
 		 408 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4289  hypothetical protein  29.8 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1568  hypothetical protein  30 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5232  hypothetical protein  29.75 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4238  hypothetical protein  25.53 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2564  hypothetical protein  27.22 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2244  hypothetical protein  28.46 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4991  hypothetical protein  26.45 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4154  hypothetical protein  24.36 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1674  hypothetical protein  23.85 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1564  hypothetical protein  27.53 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144406  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4329  hypothetical protein  26.17 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00310641  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6826  hypothetical protein  24.52 
 
 		 480 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0336179  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6244  hypothetical protein  25.85 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3958  hypothetical protein  26.32 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4994  hypothetical protein  23.8 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4748  hypothetical protein  22.03 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>