22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4991 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_4991  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  1007    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4289  hypothetical protein  25.64 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5030  protein of unknown function DUF1173  26.32 
 
 
441 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015581  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5361  hypothetical protein  26.86 
 
 
409 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0691141 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4154  hypothetical protein  24.94 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603844  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6533  hypothetical protein  31.28 
 
 
408 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350446  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6826  hypothetical protein  25.21 
 
 
480 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0336179  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4238  hypothetical protein  25.58 
 
 
403 aa  91.3  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2564  hypothetical protein  30.46 
 
 
402 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5585  hypothetical protein  32.65 
 
 
410 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28091  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2244  hypothetical protein  32.93 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6244  hypothetical protein  32.18 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3958  hypothetical protein  25.83 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4994  hypothetical protein  25 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4329  hypothetical protein  24.23 
 
 
399 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00310641  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6249  hypothetical protein  25.28 
 
 
408 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5425  hypothetical protein  22.57 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1564  hypothetical protein  26.3 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144406  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1674  hypothetical protein  31.16 
 
 
380 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252915 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4748  hypothetical protein  30.23 
 
 
429 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1568  hypothetical protein  22.74 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5232  hypothetical protein  22.51 
 
 
406 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.262246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>