More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4926 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  100 
 
 		 427 aa  842    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.36 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  37.47 
 
 		 481 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  36.84 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.09 
 
 		 459 aa  229  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  38.56 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1726  secretion protein  38.21 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.98 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.66 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.8 
 
 		 449 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 		 456 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.22 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.98 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.75 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.74 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.48 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.41 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.21 
 
 		 455 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.98 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  30.59 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.36 
 
 		 434 aa  146  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.7 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.32 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.26 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.43 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.9 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.86 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.09 
 
 		 468 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.8 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.51 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.06 
 
 		 443 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.84 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.84 
 
 		 512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.23 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  31.75 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  28.61 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.41 
 
 		 491 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.36 
 
 		 477 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.56 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  28.12 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.01 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.61 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.61 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.79 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  27.32 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  28.5 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.05 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.2 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.14 
 
 		 481 aa  117  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.36 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.38 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.91 
 
 		 449 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.27 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.65 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.63 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.34 
 
 		 480 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.06 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.06 
 
 		 494 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.38 
 
 		 488 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.28 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  24.57 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.88 
 
 		 489 aa  103  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  24.82 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.4 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.48 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  25.59 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  23.79 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  28.6 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.12 
 
 		 455 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.07 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.54 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.25 
 
 		 874 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  30.92 
 
 		 375 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  26.01 
 
 		 493 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  24.14 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  26.01 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.01 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  24.14 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  26.01 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  24.14 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  24.14 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  26.01 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  26.01 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  26.01 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  26.01 
 
 		 495 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  26.25 
 
 		 493 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  25.18 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  26.32 
 
 		 494 aa  90.5  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1277  outer membrane protein TolC, putative  25.65 
 
 		 479 aa  90.1  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  23.58 
 
 		 449 aa  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  26.09 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  27.91 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  27.36 
 
 		 497 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  26.09 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  26.21 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>