More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4208 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0440  apolipoprotein N-acyltransferase  73.64 
 
 
516 aa  704    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117561  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4208  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
548 aa  1093    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0540  apolipoprotein N-acyltransferase  61.58 
 
 
532 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0524  apolipoprotein N-acyltransferase  61.39 
 
 
532 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0553952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4762  apolipoprotein N-acyltransferase  59.44 
 
 
529 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2158  apolipoprotein N-acyltransferase  60.23 
 
 
536 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3697  apolipoprotein N-acyltransferase  55.12 
 
 
574 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1272  apolipoprotein N-acyltransferase  54.39 
 
 
550 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4184  apolipoprotein N-acyltransferase  59.31 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.39031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3832  apolipoprotein N-acyltransferase  52.02 
 
 
552 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.826992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3384  putative apolipoprotein N-acyltransferase transmembrane  53.89 
 
 
526 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  45.22 
 
 
503 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  45.22 
 
 
503 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  45.43 
 
 
523 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  42.15 
 
 
510 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  41.02 
 
 
532 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  38.5 
 
 
582 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  43.66 
 
 
524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  39.63 
 
 
567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  41.24 
 
 
562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  39.2 
 
 
567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  39.81 
 
 
562 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0586  apolipoprotein N-acyltransferase  39.84 
 
 
571 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  41.03 
 
 
562 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  38.72 
 
 
564 aa  293  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0600  apolipoprotein N-acyltransferase  39.55 
 
 
553 aa  293  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  38.16 
 
 
567 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  38.16 
 
 
567 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  36.58 
 
 
500 aa  253  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  39.28 
 
 
520 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  37.17 
 
 
500 aa  247  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  40.75 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1862  apolipoprotein N-acyltransferase  35.81 
 
 
503 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  40.84 
 
 
509 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  36.99 
 
 
497 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0883  apolipoprotein N-acyltransferase  46.84 
 
 
568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0718  apolipoprotein N-acyltransferase  46.84 
 
 
568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0703  apolipoprotein N-acyltransferase  46.84 
 
 
568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0220  apolipoprotein N-acyltransferase  46.47 
 
 
568 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2432  apolipoprotein N-acyltransferase  46.47 
 
 
568 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2726  apolipoprotein N-acyltransferase  46.47 
 
 
568 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2352  apolipoprotein N-acyltransferase  46.47 
 
 
568 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  33.99 
 
 
509 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  33.92 
 
 
509 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  34.95 
 
 
510 aa  222  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  35.51 
 
 
509 aa  223  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  32.75 
 
 
529 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
512 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
512 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
512 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  32.75 
 
 
529 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  32.75 
 
 
529 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  32.75 
 
 
529 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  32.75 
 
 
529 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
512 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
512 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
512 aa  216  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  33.19 
 
 
512 aa  216  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  35.61 
 
 
504 aa  216  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  32.82 
 
 
512 aa  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  32.68 
 
 
512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  33.11 
 
 
508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  32.9 
 
 
524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  30.38 
 
 
501 aa  213  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
521 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 
515 aa  209  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 
515 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 
515 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  33.14 
 
 
489 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  31.52 
 
 
519 aa  208  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  33.18 
 
 
537 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 
515 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 
509 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  32.59 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  30.89 
 
 
511 aa  200  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  31.71 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  31.29 
 
 
524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  31.2 
 
 
524 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.38 
 
 
518 aa  197  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
507 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
518 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  32.78 
 
 
488 aa  191  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 
516 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  36.06 
 
 
506 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  30.91 
 
 
516 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  33.59 
 
 
507 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  29.94 
 
 
519 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  32.95 
 
 
507 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  33.79 
 
 
505 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 
522 aa  186  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  34.43 
 
 
505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  34.43 
 
 
505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  30.04 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  31.51 
 
 
505 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  29.2 
 
 
506 aa  184  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  30.69 
 
 
520 aa  183  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  30.91 
 
 
532 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  35.71 
 
 
505 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>