250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3598 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3598  malate dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1432  malate dehydrogenase  97.26 
 
 		 328 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3030  malate dehydrogenase  94.51 
 
 		 328 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392331  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1803  malate dehydrogenase  91.16 
 
 		 328 aa  593  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0126909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4356  malate dehydrogenase  89.94 
 
 		 328 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2172  malate dehydrogenase  89.02 
 
 		 328 aa  587  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2206  malate dehydrogenase  88.72 
 
 		 328 aa  579  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2708  malate dehydrogenase  87.2 
 
 		 328 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2153  malate dehydrogenase  83.54 
 
 		 328 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2281  malate dehydrogenase  85.06 
 
 		 328 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1829  malate dehydrogenase  83.54 
 
 		 328 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.652638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2429  malate dehydrogenase  85.37 
 
 		 328 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2791  malate dehydrogenase  84.45 
 
 		 350 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1998  malate dehydrogenase  81.4 
 
 		 329 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304993  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0756  malate dehydrogenase  79.57 
 
 		 329 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1065  malate dehydrogenase  78.66 
 
 		 329 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.686479  normal  0.0244585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2327  malate dehydrogenase  77.44 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4651  malate dehydrogenase  76.83 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6858  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 327 aa  497  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0790  malate dehydrogenase  77.61 
 
 		 328 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108388  normal  0.0782545 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3596  malate dehydrogenase  76.22 
 
 		 328 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0658  malate dehydrogenase  76.22 
 
 		 327 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4358  malate dehydrogenase  75.3 
 
 		 327 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2898  malate dehydrogenase  75.61 
 
 		 327 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4435  malate dehydrogenase  76.22 
 
 		 328 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3932  malate dehydrogenase  76.22 
 
 		 328 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.566421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1751  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0795  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2154  malate dehydrogenase  75.3 
 
 		 328 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3825  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2489  malate dehydrogenase  75.61 
 
 		 327 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.210751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3309  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1619  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1827  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.723795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2474  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2336  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0497  malate dehydrogenase  75.91 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0941878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02545  malate dehydrogenase  76.69 
 
 		 328 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0460  malate dehydrogenase  71.95 
 
 		 329 aa  487  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0503945  normal  0.124945 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0485  malate dehydrogenase  74.85 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0550  malate dehydrogenase  74.23 
 
 		 328 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2552  malate dehydrogenase  68.58 
 
 		 329 aa  447  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2867  malate dehydrogenase  67.98 
 
 		 328 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1673  malate dehydrogenase  67.99 
 
 		 327 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3063  malate dehydrogenase  66.77 
 
 		 327 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2161  malate dehydrogenase  65.81 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.555081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4642  malate dehydrogenase  61.59 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1713  malate dehydrogenase  62.27 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0830  malate dehydrogenase  62.08 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.592408  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1873  malate dehydrogenase  63.72 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0651277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0864  malate dehydrogenase  59.94 
 
 		 327 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0487  malate dehydrogenase  61.16 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1659  malate dehydrogenase  61.77 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000634341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11265  malate dehydrogenase  60.67 
 
 		 329 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000004944  decreased coverage  0.000678049 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1763  malate dehydrogenase  62.61 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0978  malate dehydrogenase  60.74 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2044  malate dehydrogenase  62.01 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.375766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5280  malate dehydrogenase  61.16 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0092  malate dehydrogenase  59.45 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.021843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3578  malate dehydrogenase  58.23 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07840  malate dehydrogenase  58.15 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.172278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0774  malate dehydrogenase  58.84 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1617  malate dehydrogenase  57.93 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.814638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6492  malate dehydrogenase  59.15 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19950  malate dehydrogenase  57.32 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000211978  hitchhiker  0.000178051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4209  malate dehydrogenase  58.23 
 
 		 329 aa  363  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.432377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2256  malate dehydrogenase  58.54 
 
 		 328 aa  362  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133254  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1259  malate dehydrogenase  58.1 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7973  malate dehydrogenase  57.93 
 
 		 329 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2403  malate dehydrogenase  54.98 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.433126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0610  malate dehydrogenase  56.27 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.18375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4268  malate dehydrogenase  55.96 
 
 		 325 aa  348  6e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0186905  normal  0.0169566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3441  malate dehydrogenase  55.49 
 
 		 329 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28070  malate dehydrogenase (NAD)  56.1 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0979887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2659  malate dehydrogenase  56.66 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2522  malate dehydrogenase  57.1 
 
 		 330 aa  342  7e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0230761  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2669  malate dehydrogenase  52.74 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.493712  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0258  malate dehydrogenase  52.74 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3006  malate dehydrogenase  58.36 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3339  malate dehydrogenase  52.91 
 
 		 331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3067  malate dehydrogenase  54.13 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.583103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1133  malate dehydrogenase  53.05 
 
 		 329 aa  322  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.275779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0743  malate dehydrogenase  51.85 
 
 		 328 aa  315  9e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00985263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1290  malate dehydrogenase  53.66 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1436  malate dehydrogenase  52.44 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0688  malate dehydrogenase  51.23 
 
 		 327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1384  malate dehydrogenase  50.46 
 
 		 328 aa  305  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1325  malate dehydrogenase  50.15 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0597449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2783  malate dehydrogenase  52.13 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42336  predicted protein  47.11 
 
 		 430 aa  292  6e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22262  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2274  malate dehydrogenase  51.22 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2301  malate dehydrogenase  51.22 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00950  malate dehydrogenase  49.41 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0511  malate dehydrogenase  53.21 
 
 		 329 aa  287  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0813  malate dehydrogenase  49.24 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1880  malate dehydrogenase  49.54 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0655  malate dehydrogenase  46.18 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87414  predicted protein  45.25 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  26.38 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.29 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>