More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1114 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1509  signal recognition particle protein  87.16 
 
 		 464 aa  770    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0870  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  90.35 
 
 		 459 aa  784    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.414997  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2936  signal recognition particle protein  90.12 
 
 		 459 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.949898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3626  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  90.12 
 
 		 459 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0376  signal recognition particle protein  85.14 
 
 		 455 aa  773    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0962  signal recognition particle protein  89.88 
 
 		 462 aa  776    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1502  signal recognition particle protein  84.96 
 
 		 454 aa  765    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3342  signal recognition particle protein  88.94 
 
 		 454 aa  770    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3220  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  82.33 
 
 		 457 aa  713    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.604679  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1114  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 452 aa  902    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3379  signal recognition particle protein  92.94 
 
 		 452 aa  798    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  70.42 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0516  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  71.52 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3515  signal recognition particle protein  69.98 
 
 		 455 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  70.42 
 
 		 455 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0108  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  70.91 
 
 		 455 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  70.2 
 
 		 455 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3440  signal recognition particle protein  70.42 
 
 		 455 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000127392  hitchhiker  0.000711681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  69.98 
 
 		 455 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.54 
 
 		 455 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2947  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.6 
 
 		 462 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3094  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  70.11 
 
 		 463 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0219  signal recognition particle protein  68.79 
 
 		 460 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.382066  normal  0.73779 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0201  signal recognition particle protein  70.87 
 
 		 460 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2811  putative signal recognition particle protein  68.41 
 
 		 476 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.626548  normal  0.183839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  66.67 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2646  signal recognition particle protein  69.69 
 
 		 471 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3056  signal recognition particle protein  69.47 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  65.25 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0642  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.6 
 
 		 455 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.821014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.57 
 
 		 450 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  61.4 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  62.17 
 
 		 457 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  64.34 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  64.34 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  64.34 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  64.34 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.64 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  64.34 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  64.34 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  64.34 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  64.34 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  60.41 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  64.1 
 
 		 453 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  62.23 
 
 		 453 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  62.13 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  63.87 
 
 		 453 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  63.87 
 
 		 453 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  63.87 
 
 		 453 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  63.87 
 
 		 453 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  64.1 
 
 		 453 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  63.87 
 
 		 453 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  62.73 
 
 		 453 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  59.64 
 
 		 478 aa  528  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  62.5 
 
 		 453 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  62.73 
 
 		 453 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  62.5 
 
 		 453 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  63.11 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  61.78 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  62.39 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  61.5 
 
 		 457 aa  527  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  61.47 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  61.24 
 
 		 453 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  58.35 
 
 		 452 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  59.47 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  58.98 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  61.68 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  60.88 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0851  signal recognition particle protein  62 
 
 		 453 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000129048  hitchhiker  0.0000234744 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  61.87 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  62.1 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  61.87 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  60.44 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  58.19 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  58.19 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  59.16 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0094  signal recognition particle protein  63.76 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000225089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  59.05 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1018  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.43 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2755  signal recognition particle protein  61.95 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.77 
 
 		 456 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.51 
 
 		 511 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  61.67 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03481  hypothetical protein  62.71 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  57.34 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3402  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.05 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3368  signal recognition particle protein  59.33 
 
 		 457 aa  495  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1373  signal recognition particle protein Ffh  59.52 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  56.44 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1167  signal recognition particle protein  61.68 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1286  signal recognition particle protein  61.9 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000571618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>