More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7151 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1802  putative ATP-binding ABC transporter protein  69.91 
 
 
660 aa  737    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235384  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1808  ABC transporter related  79.67 
 
 
672 aa  907    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.762366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  75.45 
 
 
676 aa  835    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3856  ABC transporter related  80.25 
 
 
559 aa  909    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2351  ABC transpoter ATPase  78.32 
 
 
650 aa  860    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  70.78 
 
 
673 aa  806    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2715  ABC transporter related  71.38 
 
 
650 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2078  ABC transporter-related protein  68.07 
 
 
654 aa  719    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  74.95 
 
 
656 aa  838    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7151  ABC transporter related  100 
 
 
554 aa  1136    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.478249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  80.51 
 
 
651 aa  915    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1992  ABC transporter related  79.31 
 
 
678 aa  910    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0300  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  96.74 
 
 
559 aa  1026    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  59.26 
 
 
640 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1759  ABC transporter-related protein  95.83 
 
 
554 aa  1088    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656937  normal  0.0503302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  74.95 
 
 
656 aa  838    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  74.09 
 
 
687 aa  828    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  58.7 
 
 
643 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  60.56 
 
 
645 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  60.19 
 
 
692 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  59.04 
 
 
643 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  60.37 
 
 
676 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  56.75 
 
 
657 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  56.57 
 
 
650 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  59.44 
 
 
646 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  59.44 
 
 
646 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  56.91 
 
 
646 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
646 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  59.44 
 
 
646 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
646 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
646 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
646 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
646 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  58.67 
 
 
643 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  58.67 
 
 
643 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  58.67 
 
 
643 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  58.33 
 
 
643 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  58.86 
 
 
643 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1937  ABC transporter related  59.39 
 
 
628 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.832952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  51.66 
 
 
637 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  51.66 
 
 
637 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  51.66 
 
 
637 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
637 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
637 aa  568  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
637 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
637 aa  568  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
637 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
637 aa  568  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  52.29 
 
 
656 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.48 
 
 
635 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.48 
 
 
635 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
639 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.48 
 
 
635 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  52.11 
 
 
636 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  51 
 
 
633 aa  559  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.29 
 
 
637 aa  559  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  50.18 
 
 
636 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  52.66 
 
 
650 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  50.27 
 
 
659 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  52.03 
 
 
637 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.72 
 
 
637 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  51.93 
 
 
637 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  52.11 
 
 
637 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  51.54 
 
 
636 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  52.03 
 
 
657 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  52.11 
 
 
637 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  52.11 
 
 
637 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  51.93 
 
 
637 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  51.93 
 
 
637 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
634 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  49.73 
 
 
639 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  51.93 
 
 
637 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 
640 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
638 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.48 
 
 
640 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 
640 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  50.72 
 
 
636 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  51.27 
 
 
636 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  51.93 
 
 
636 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  51.72 
 
 
638 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  51.74 
 
 
647 aa  538  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  52.53 
 
 
642 aa  532  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  50.18 
 
 
636 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  51.48 
 
 
635 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  52.22 
 
 
650 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  50.46 
 
 
633 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  49.72 
 
 
638 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  52.41 
 
 
672 aa  529  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  50.18 
 
 
636 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  50.55 
 
 
636 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  50.27 
 
 
635 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  52.95 
 
 
639 aa  525  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.36 
 
 
638 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  50.37 
 
 
651 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  49.55 
 
 
648 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  49.1 
 
 
643 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>