18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6801 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6801  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0122281  decreased coverage  0.0000000557857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2845  hypothetical protein  94.83 
 
 
59 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0350993  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4408  hypothetical protein  81.03 
 
 
58 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75876  normal  0.436644 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1677  hypothetical protein  85.71 
 
 
52 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0333  hypothetical protein  85.71 
 
 
52 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2424  hypothetical protein  85.71 
 
 
52 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2561  hypothetical protein  85.71 
 
 
52 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0302  hypothetical protein  85.71 
 
 
52 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1481  hypothetical protein  85.71 
 
 
52 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0596  hypothetical protein  85.71 
 
 
52 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0864  hypothetical protein  85.71 
 
 
52 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219242  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3863  hypothetical protein  73.08 
 
 
58 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0392058  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4501  hypothetical protein  73.08 
 
 
58 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0584881  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3664  hypothetical protein  73.08 
 
 
58 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0561841  normal  0.750384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4882  hypothetical protein  71.15 
 
 
58 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136917  hitchhiker  0.00145502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3231  hypothetical protein  71.15 
 
 
58 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531201  normal  0.0645002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3760  hypothetical protein  71.15 
 
 
58 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703241  hitchhiker  0.00130051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2233  hypothetical protein  67.31 
 
 
58 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223216  normal  0.27582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>