33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4070 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4070  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  190  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.265953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  75.51 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  67.44 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  67.44 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  63.04 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  63.04 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  59.32 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  59.32 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  59.32 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  63.04 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  59.32 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  59.32 
 
 
243 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  59.32 
 
 
246 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  55.36 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  57.63 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  58.49 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  51.67 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  66.67 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  53.45 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  64.29 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  60.87 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  51.92 
 
 
141 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  51.06 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  46.15 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  73.33 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  46.3 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  47.73 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  47.73 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  57.14 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  57.14 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  41.43 
 
 
391 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  50 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  50 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>