More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4066 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4066  ABC transporter related  100 
 
 
288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0520  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  93.4 
 
 
288 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  86.42 
 
 
296 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  86.42 
 
 
296 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  86.42 
 
 
296 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  86.04 
 
 
296 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  85.66 
 
 
296 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  86.04 
 
 
296 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  86.04 
 
 
296 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  83.03 
 
 
282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  82.67 
 
 
282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  82.67 
 
 
282 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  86.31 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  82.67 
 
 
282 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  86.31 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  85.21 
 
 
280 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2424  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  87.21 
 
 
302 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4044  ABC transporter related  81.75 
 
 
281 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  50 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  48.22 
 
 
274 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  51.16 
 
 
282 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  50.38 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  47.24 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  46.33 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 
255 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 
270 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  48.52 
 
 
267 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  47.43 
 
 
285 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  46.72 
 
 
284 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  43.85 
 
 
269 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  46.27 
 
 
263 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  42.13 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  44.49 
 
 
273 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
273 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 
265 aa  225  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  43.08 
 
 
255 aa  225  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  43.46 
 
 
269 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  44.09 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
293 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  42.69 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
257 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
273 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
273 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 
260 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  47.84 
 
 
266 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  44.09 
 
 
273 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
273 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
273 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
273 aa  222  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  47.84 
 
 
284 aa  222  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  43.48 
 
 
267 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  47.06 
 
 
285 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
260 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  44.27 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  46.92 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.29 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  44.49 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  47.18 
 
 
278 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  41.92 
 
 
265 aa  219  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  41.92 
 
 
265 aa  219  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  45.1 
 
 
266 aa  218  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
279 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 
267 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  40.78 
 
 
259 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
264 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  43.51 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  44.06 
 
 
292 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
264 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
264 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
263 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  42.48 
 
 
281 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  44.88 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  43.92 
 
 
273 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 
254 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
264 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
264 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  42.69 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>