214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3581 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3581  flagellar L-ring protein  100 
 
 
223 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0077729  hitchhiker  0.00000182605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0377  putative flagellar L-ring protein precursor(basal body L-ring protein), FlgH  96.02 
 
 
239 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  82.69 
 
 
228 aa  349  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  36.2 
 
 
233 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  36 
 
 
225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  34.65 
 
 
227 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  34.88 
 
 
224 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  37.96 
 
 
237 aa  121  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  36.17 
 
 
219 aa  121  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  32.91 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  32.91 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  32.43 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  36.95 
 
 
229 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  39.9 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  35.44 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  37.93 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  34.95 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  38.24 
 
 
243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  34.47 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  34.47 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  34.47 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  35.06 
 
 
232 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  33.78 
 
 
232 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  36.91 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  36.91 
 
 
243 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  33.78 
 
 
239 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  33.03 
 
 
230 aa  115  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  33.98 
 
 
230 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  34.82 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  35.1 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  35.89 
 
 
236 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  34.2 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  35.91 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  29.77 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  30.05 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  34.33 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  34.33 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  37.37 
 
 
232 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  31.16 
 
 
224 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  33.93 
 
 
233 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  29.91 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 
230 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  31.51 
 
 
234 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  33.17 
 
 
229 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
224 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  32.8 
 
 
237 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  34.63 
 
 
235 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  34.27 
 
 
239 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  29.17 
 
 
234 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  30.58 
 
 
224 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  31.19 
 
 
224 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 
224 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
221 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
221 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
221 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
221 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
221 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  34.11 
 
 
237 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
232 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  29.61 
 
 
224 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  29.61 
 
 
224 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  30.1 
 
 
224 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  29.61 
 
 
224 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  29.61 
 
 
224 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  28.7 
 
 
229 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  37.02 
 
 
232 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  37.02 
 
 
235 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
232 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
232 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
232 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 
235 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  37.02 
 
 
232 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  32.55 
 
 
219 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  32.55 
 
 
223 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  31.46 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  31.1 
 
 
220 aa  99  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  31.16 
 
 
222 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  32.35 
 
 
231 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  32.96 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  32.12 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  30.59 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  29.44 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  32.86 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  37.11 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  30.59 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  33.79 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  31.6 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  37.11 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  33.02 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  32.48 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  29.81 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>