More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2165 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2099  putative short-chain dehydrogenase/reductase, TsaC-like  94.74 
 
 
247 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0319  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  76.92 
 
 
247 aa  380  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0139781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.92 
 
 
263 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.699025 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.92 
 
 
268 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.92 
 
 
268 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2504  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.52 
 
 
247 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.52 
 
 
247 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452091  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.11 
 
 
247 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0557888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 
254 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.85 
 
 
246 aa  265  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
246 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.958855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
251 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.549634  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
251 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3531  putative short-chain dehydrogenase  48.61 
 
 
256 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138901  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0740528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
253 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
249 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
250 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
249 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
247 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
249 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
249 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
249 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
246 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
246 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
249 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
247 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
249 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
253 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
246 aa  148  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.84 
 
 
249 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
256 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
249 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
247 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
249 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.18 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
246 aa  144  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
249 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
246 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
245 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
247 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
246 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
249 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
245 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
246 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
252 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
248 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
262 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
249 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
253 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
249 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
247 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
245 aa  142  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
247 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
249 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.3 
 
 
248 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 
247 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
249 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
250 aa  141  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
246 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.92 
 
 
242 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.3 
 
 
246 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
258 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
246 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.82 
 
 
246 aa  138  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.7 
 
 
240 aa  138  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.69 
 
 
246 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.3 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.18 
 
 
245 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13073  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein  37.25 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 
244 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
247 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.3 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
249 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
241 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
282 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
255 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2776  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 
248 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.14 
 
 
246 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 
247 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>