22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1671 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1671  putative signal peptide transmembrane protein  100 
 
 
367 aa  763    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.505557  normal  0.644124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2779  putative signal peptide transmembrane protein  88.49 
 
 
309 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0265643  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1277  hypothetical protein  64.18 
 
 
323 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000935938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1801  hypothetical protein  67.97 
 
 
332 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00434642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1780  hypothetical protein  67.97 
 
 
332 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0149316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0129  hypothetical protein  64.26 
 
 
336 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000566472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1766  hypothetical protein  64.26 
 
 
336 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000723457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1956  hypothetical protein  63.48 
 
 
323 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113781  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1053  hypothetical protein  68.67 
 
 
305 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1533  hypothetical protein  68.67 
 
 
305 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4673  hypothetical protein  64.03 
 
 
305 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0103539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1509  hypothetical protein  60.46 
 
 
305 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728748  hitchhiker  0.000463306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1455  hypothetical protein  69.64 
 
 
306 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1415  hypothetical protein  68.83 
 
 
309 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2530  hypothetical protein  66.67 
 
 
321 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3594  hypothetical protein  47.43 
 
 
299 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0427  lipoprotein transmembrane  41.67 
 
 
305 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100979  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0412  putative lipoprotein transmembrane  40.48 
 
 
305 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2036  putative lipoprotein transmembrane  35.96 
 
 
335 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000209555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0534  lipoprotein transmembrane  40.49 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26607  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2255  protein of unknown function DUF1571  23.29 
 
 
279 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3142  protein of unknown function DUF1571  29.17 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>