More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0080 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0080  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  965    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1123  putative aldehyde dehydrogenase  83.3 
 
 
475 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1106  putative aldehyde dehydrogenase  84.63 
 
 
475 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2258  aldehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
473 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0191604  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3504  aldehyde dehydrogenase  47.61 
 
 
474 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2607  aldehyde Dehydrogenase  46.37 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1506  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
472 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.58 
 
 
510 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
505 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
505 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
505 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  36.96 
 
 
512 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  36.68 
 
 
509 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.75 
 
 
522 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.92 
 
 
551 aa  223  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  33.18 
 
 
533 aa  222  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  33.62 
 
 
531 aa  220  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  33.48 
 
 
521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  34.68 
 
 
518 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.96 
 
 
521 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
457 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.31 
 
 
540 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 
455 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  33.49 
 
 
489 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.32 
 
 
541 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
461 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
525 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  37.25 
 
 
499 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  34.08 
 
 
505 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.42 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
538 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  34.1 
 
 
461 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3686  Aldehyde Dehydrogenase  33.4 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.67 
 
 
489 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.52 
 
 
488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.22 
 
 
483 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  32.23 
 
 
510 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.67 
 
 
489 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  33.64 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.09 
 
 
489 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  32.67 
 
 
489 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.13 
 
 
470 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  32.89 
 
 
489 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.31 
 
 
483 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.89 
 
 
489 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  32.89 
 
 
489 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  32.96 
 
 
484 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.89 
 
 
489 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
491 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  32.48 
 
 
475 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  32.89 
 
 
489 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  32.48 
 
 
475 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
491 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  34.82 
 
 
492 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
491 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.76 
 
 
488 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  32.92 
 
 
460 aa  193  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  32.67 
 
 
489 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  33.13 
 
 
506 aa  192  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.39 
 
 
486 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.42 
 
 
488 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.12 
 
 
491 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.45 
 
 
486 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.87 
 
 
483 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  33.49 
 
 
476 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.46 
 
 
483 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.46 
 
 
483 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.63 
 
 
484 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.46 
 
 
483 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.96 
 
 
487 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.46 
 
 
483 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  28.05 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  30.42 
 
 
488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  35.71 
 
 
493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  31.7 
 
 
463 aa  191  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  32.4 
 
 
485 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.79 
 
 
489 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.76 
 
 
540 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.42 
 
 
483 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.79 
 
 
489 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.79 
 
 
489 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.79 
 
 
489 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  34.23 
 
 
467 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.65 
 
 
483 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  33.19 
 
 
490 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.28 
 
 
499 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.28 
 
 
499 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.02 
 
 
483 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  33.25 
 
 
467 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.93 
 
 
487 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.98 
 
 
483 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
468 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.84 
 
 
481 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.11 
 
 
495 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  29.85 
 
 
491 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.38 
 
 
479 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  33.1 
 
 
476 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.75 
 
 
517 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  31.78 
 
 
499 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>