More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6755 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4172  AAA ATPase, central region  74.72 
 
 
540 aa  856    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6755  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
540 aa  1122    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0274  AAA family ATPase  44.06 
 
 
547 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0342467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0262  AAA family ATPase  41.27 
 
 
558 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.673428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2165  ATPase  40.63 
 
 
560 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18070  ATPase, AAA superfamily  41.14 
 
 
585 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1771  AAA ATPase central domain protein  42.83 
 
 
570 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2338  ATPase central domain-containing protein  41.02 
 
 
571 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1077  ATPase central domain-containing protein  38.3 
 
 
567 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0956592 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1499  ATPase, AAA family  40.38 
 
 
553 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.790722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1217  AAA ATPase central domain protein  40.38 
 
 
565 aa  363  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000255374  hitchhiker  0.0000000181039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1175  ATPase central domain-containing protein  38.99 
 
 
574 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700331  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0047  ATPase central domain-containing protein  39.37 
 
 
608 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4152  AAA ATPase central domain protein  39.87 
 
 
534 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  37.24 
 
 
822 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01591  conserved hypothetical protein  38.24 
 
 
924 aa  127  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181362  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07091  hypothetical protein  31.3 
 
 
753 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03615  conserved hypothetical protein  38.6 
 
 
1049 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.391595  normal  0.0454206 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  28.52 
 
 
697 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  31.49 
 
 
646 aa  74.3  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 
725 aa  73.6  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.53 
 
 
617 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  33.33 
 
 
772 aa  71.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  31.93 
 
 
775 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  31.61 
 
 
771 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  32.28 
 
 
773 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  32.28 
 
 
773 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  29.03 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  30.5 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  33.1 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  31.55 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  30.82 
 
 
744 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  29.79 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  31.25 
 
 
771 aa  67.8  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.13 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  30.38 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  31.32 
 
 
639 aa  67  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  27.21 
 
 
299 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  32.41 
 
 
766 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  30 
 
 
448 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  34.23 
 
 
795 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  29.08 
 
 
450 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  28.57 
 
 
619 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  29.9 
 
 
450 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  28.76 
 
 
442 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  27.14 
 
 
787 aa  64.3  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  31.58 
 
 
578 aa  64.3  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 
459 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  27.36 
 
 
569 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  31.98 
 
 
414 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  27.97 
 
 
432 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  32.21 
 
 
749 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 
731 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  29.28 
 
 
665 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  31.9 
 
 
680 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  28.4 
 
 
387 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  29.83 
 
 
653 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  30.64 
 
 
360 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  30.39 
 
 
657 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  26.95 
 
 
662 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  31.88 
 
 
676 aa  60.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  28.93 
 
 
652 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  29.23 
 
 
478 aa  61.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  30.28 
 
 
1193 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  30.5 
 
 
725 aa  60.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  29.79 
 
 
656 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 
678 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  30.5 
 
 
656 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  28.57 
 
 
655 aa  60.1  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  35.25 
 
 
698 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  31.15 
 
 
444 aa  60.1  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 
711 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  34.31 
 
 
687 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  26.14 
 
 
640 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  27.43 
 
 
743 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  31.65 
 
 
671 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  30.46 
 
 
789 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  32.24 
 
 
689 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  23.78 
 
 
570 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  23.78 
 
 
570 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  23.78 
 
 
570 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  34.59 
 
 
369 aa  57.4  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  28.57 
 
 
317 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  30.06 
 
 
325 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  27.03 
 
 
370 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 
698 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  26.7 
 
 
956 aa  57  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  31.15 
 
 
305 aa  57  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  31.01 
 
 
789 aa  57  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  33.09 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07047  membrane-spanning ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03990)  29.03 
 
 
410 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  32.56 
 
 
753 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  26.16 
 
 
327 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  26.16 
 
 
327 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  30.15 
 
 
239 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  31.11 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  28.1 
 
 
328 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01640  ATPase, putative  27.06 
 
 
1159 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  29.17 
 
 
448 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>