41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6329 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0861  protein of unknown function DUF1479  85.51 
 
 
414 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0160738  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6329  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  856    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.86136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2192  putative cytoplasmic protein of unknown function(DUF1479)  91.79 
 
 
414 aa  784    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240391 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0511  hypothetical protein  68.77 
 
 
414 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00707678  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1738  putative dioxygenase  68.77 
 
 
414 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0566606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1841  putative dioxygenase  68.77 
 
 
414 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000734173  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1633  putative dioxygenase  68.77 
 
 
414 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00002202  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0669  dioxygenase, putative  68.77 
 
 
414 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000518356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2463  hypothetical protein  68.52 
 
 
414 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000168739  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0784  hypothetical protein  68.28 
 
 
414 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.016275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2325  hypothetical protein  68.28 
 
 
414 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4425  hypothetical protein  66.75 
 
 
416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3942  hypothetical protein  66.75 
 
 
416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290793  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3586  hypothetical protein  66.75 
 
 
416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2144  hypothetical protein  66.1 
 
 
416 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802554  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3836  hypothetical protein  66.59 
 
 
417 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.444137  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4640  hypothetical protein  65.7 
 
 
416 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3319  hypothetical protein  65.62 
 
 
417 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.733251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3403  hypothetical protein  62.14 
 
 
415 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1333  hypothetical protein  59.12 
 
 
415 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1445  hypothetical protein  59.12 
 
 
415 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2727  hypothetical protein  59.12 
 
 
415 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2527  hypothetical protein  45.58 
 
 
421 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00600019  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00805  hypothetical protein  45.58 
 
 
421 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0846  hypothetical protein  45.35 
 
 
421 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00788  hypothetical protein  45.58 
 
 
421 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0892  hypothetical protein  45.58 
 
 
421 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0879  hypothetical protein  45.58 
 
 
421 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2821  protein of unknown function DUF1479  45.58 
 
 
421 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0970  hypothetical protein  45.35 
 
 
421 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348574  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0991  putative cytoplasmic protein  44.63 
 
 
421 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.720736  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0909  hypothetical protein  44.39 
 
 
421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0881  putative cytoplasmic protein  44.63 
 
 
421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1315  hypothetical protein  44.36 
 
 
420 aa  360  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0970  hypothetical protein  43.9 
 
 
421 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0941  hypothetical protein  44.15 
 
 
421 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04729  DUF1479 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09280)  32.31 
 
 
476 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01480  conserved hypothetical protein  32.63 
 
 
510 aa  199  7e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920378  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48836  predicted protein  29.71 
 
 
469 aa  169  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61764  predicted protein  27.6 
 
 
480 aa  143  6e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03660  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 
224 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>