37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6189 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6189  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  246  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209827  normal  0.0285321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1689  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000187048  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0944  hypothetical protein  44.05 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2379  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.67 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1287  Invasion gene expression up-regulator SirB  33.61 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0999  invasion gene expression up-regulator, SirB  36.97 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2564  hypothetical protein  35.56 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.44085  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3554  invasion gene expression up-regulator SirB  37.19 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2077  invasion gene expression up-regulator, SirB  30 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0412299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3550  SirB family protein  40.86 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480134  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1885  invasion gene expression up-regulator, SirB  39.52 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1005  hypothetical protein  37.3 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0820181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3677  invasion gene expression up-regulator SirB  35.96 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3453  invasion gene expression up-regulator, SirB  35.56 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3830  hypothetical protein  33.71 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0772  invasion gene expression up-regulator, SirB  32.58 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3166  invasion gene expression up-regulator, SirB  32.58 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0800  invasion gene expression up-regulator, SirB  32.58 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2907  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.46 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.493009  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0725  invasion gene expression up-regulator, SirB  30.34 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0700  invasion gene expression up-regulator SirB  31.46 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3611  invasion gene expression up-regulator SirB  31.46 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0384528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3543  Invasion gene expression up-regulator SirB  31.46 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.637299  hitchhiker  0.0000269359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3734  invasion gene expression up-regulator SirB  31.46 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0806  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.46 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4728  invasion gene expression up-regulator, SirB  36.97 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0922  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.46 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3124  invasion gene expression up-regulator SirB  31.46 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1462  hypothetical protein  34.75 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.211632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02569  Invasion gene expression up-regulator, SirB  34.48 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351393  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2402  invasion gene expression up-regulator, SirB  30.97 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1992  invasion gene expression up-regulator SirB  31.4 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0896381  hitchhiker  0.00421382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03873  Invasion gene expression up-regulator, SirB  35.62 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2560  invasion gene expression up-regulator, SirB  27.97 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0147676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1330  invasion gene expression up-regulator, SirB  36.21 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50154  normal  0.673859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01252  hypothetical protein  28.35 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2112  Invasion gene expression up-regulator SirB  29.66 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>