79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3089 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_3089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
137 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000507937  unclonable  0.00000000000000144798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0115  glyoxalase family protein  71.53 
 
 
138 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000344124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0114  glyoxalase family protein  71.53 
 
 
138 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000210861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0131  glyoxalase family protein  71.53 
 
 
138 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000275668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2299  glyoxalase family protein  71.53 
 
 
138 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000195056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2837  glyoxalase family protein  71.53 
 
 
138 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000107738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0321  glyoxalase family protein  71.53 
 
 
138 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000322119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2322  glyoxalase family protein  71.53 
 
 
138 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000000100252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2248  glyoxalase family protein  71.53 
 
 
138 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.18 
 
 
141 aa  197  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000520139  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4481  putative lactoylglutathione lyase  66.18 
 
 
141 aa  193  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298655  unclonable  0.00000133457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.19 
 
 
137 aa  187  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000178969  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.93 
 
 
137 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000010528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.93 
 
 
137 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310756  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.93 
 
 
137 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657624  decreased coverage  0.000000082582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0084  glyoxalase family protein  68.61 
 
 
138 aa  186  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000575972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3206  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.93 
 
 
143 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000404623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.92 
 
 
137 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000152154  decreased coverage  0.00078643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.16 
 
 
137 aa  176  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451164  unclonable  0.00000000000414135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29360  glyoxalase, Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  52.24 
 
 
135 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3236  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.59 
 
 
136 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0144  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.21 
 
 
137 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4885  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.77 
 
 
150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2605  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.77 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123177  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06892  methylmalonyl CoA epimerase  49.19 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.73 
 
 
145 aa  123  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.51 
 
 
139 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.51 
 
 
139 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.04 
 
 
141 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3398  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.8 
 
 
136 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.56 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127452  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000895  lactoylglutathione lyase  46.97 
 
 
141 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.75 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2248  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
135 aa  107  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.887282  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.88 
 
 
136 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2691  putative ring-cleaving dioxygenase  41.79 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31640  putative ring-cleaving dioxygenase  41.98 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.195652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1685  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2195  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.811141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  30 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0872  glyoxalase family protein  29.69 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0011  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1322  hypothetical protein  30.4 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.781159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1734  glyoxalase family protein  31.78 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.96 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.604998  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.184325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4122  hypothetical protein  29.6 
 
 
195 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255655  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 
329 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0851141  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  31.25 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.31 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000365872  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  31.25 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  32.73 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0360  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.09 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
131 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4634  ring-cleaving dioxygenase  33.59 
 
 
126 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0767303  normal  0.10787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52890  ring-cleaving dioxygenase  34.11 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908262  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0866  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.37 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4030  hypothetical protein  26.67 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0045  ring-cleaving dioxygenase  31.01 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.985794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>