126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2342 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03417  xylose isomerase  69.04 
 
 		 440 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0145  xylose isomerase  68.81 
 
 		 440 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3002  xylose isomerase  71.23 
 
 		 438 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123977  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2883  xylose isomerase  70.78 
 
 		 438 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2303  xylose isomerase  69.34 
 
 		 438 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.618327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2338  xylose isomerase  78.08 
 
 		 440 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2622  xylose isomerase  79 
 
 		 440 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527813 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6506  xylose isomerase  79.63 
 
 		 440 aa  746    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3726  xylose isomerase  67.13 
 
 		 439 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658908  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6332  xylose isomerase  78.95 
 
 		 440 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6740  xylose isomerase  79.63 
 
 		 440 aa  746    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0817214  normal  0.561733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0156  xylose isomerase  68.58 
 
 		 440 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4102  xylose isomerase  68.81 
 
 		 439 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3768  xylose isomerase  69.04 
 
 		 440 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.986128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4061  xylose isomerase  69.04 
 
 		 440 aa  646    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0098  xylose isomerase  68.35 
 
 		 439 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4437  xylose isomerase  69.72 
 
 		 440 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4207  xylose isomerase  79.68 
 
 		 440 aa  752    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4161  xylose isomerase  68.81 
 
 		 439 aa  644    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667715  normal  0.0336803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0056  xylose isomerase  68.81 
 
 		 439 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0149  xylose isomerase  69.04 
 
 		 440 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3888  xylose isomerase  69.04 
 
 		 440 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6329  xylose isomerase  79.63 
 
 		 440 aa  745    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6032  xylose isomerase  78.49 
 
 		 440 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.383264  normal  0.793977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2342  xylose isomerase  100 
 
 		 441 aa  916    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3959  xylose isomerase  69.04 
 
 		 440 aa  646    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6633  xylose isomerase  77.85 
 
 		 440 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3939  xylose isomerase  69.95 
 
 		 440 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.619988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3984  xylose isomerase  69.95 
 
 		 440 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3857  xylose isomerase  69.95 
 
 		 440 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3875  xylose isomerase  69.95 
 
 		 440 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4044  xylose isomerase  70.18 
 
 		 440 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4941  xylose isomerase  69.04 
 
 		 440 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0307022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0078  xylose isomerase  68.58 
 
 		 439 aa  641    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03368  hypothetical protein  69.04 
 
 		 440 aa  645    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0060  xylose isomerase  68.81 
 
 		 439 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4155  xylose isomerase  69.95 
 
 		 440 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0587  xylose isomerase  65.83 
 
 		 441 aa  632  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1876  xylose isomerase  66.9 
 
 		 439 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.554303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2820  xylose isomerase  61.75 
 
 		 436 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2789  xylose isomerase  61.29 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3832  xylose isomerase  61.75 
 
 		 435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0757  xylose isomerase  62.73 
 
 		 437 aa  561  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3411  xylose isomerase  59.91 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0547  xylose isomerase  59.91 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2714  xylose isomerase  60.83 
 
 		 440 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0549  xylose isomerase  59.68 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3411  xylose isomerase  59.22 
 
 		 436 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3709  xylose isomerase  59.45 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0029  xylose isomerase  57.6 
 
 		 436 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1733  xylose isomerase  57.51 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.382603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1996  xylose isomerase  59.3 
 
 		 434 aa  542  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00412566  normal  0.553751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2615  xylose isomerase  57.6 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1176  xylose isomerase  57.83 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0800628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2838  xylose isomerase  57.83 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0695629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0454  xylose isomerase  58.54 
 
 		 399 aa  500  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1929  xylose isomerase  54.38 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116682  normal  0.849458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1219  xylose isomerase  52.75 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0153  xylose isomerase  48.86 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19530  xylose isomerase  50.68 
 
 		 439 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00110  xylose isomerase  51.39 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03848  xylose isomerase  51.39 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3429  xylose isomerase  48.62 
 
 		 439 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1757  xylose isomerase  50.92 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0603  xylose isomerase  49.77 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1604  xylose isomerase  50.69 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1287  xylose isomerase  49.54 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4384  xylose isomerase  51.83 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0452947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2443  xylose isomerase  49.32 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2504  xylose isomerase  48.74 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.149653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1124  xylose isomerase  47.61 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3039  xylose isomerase  47.95 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2180  xylose isomerase  48.17 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000174675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1162  xylose isomerase  47.38 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000276678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4723  xylose isomerase  51.39 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2688  xylose isomerase  49.2 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0349  xylose isomerase  48.85 
 
 		 443 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_30786  xylose isomerase  46.64 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2001  xylose isomerase  47.47 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2210  xylose isomerase  46.68 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0226  xylose isomerase  46.12 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.829605  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0130  xylose isomerase  43.24 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00829449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1871  xylose isomerase  42.26 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.322052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1596  xylose isomerase  47.81 
 
 		 389 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  29.76 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  32.34 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  30.95 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  28.92 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  31.09 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  29.85 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  29.62 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  30.62 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  28.3 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  26.97 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  27.23 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  30.79 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  27.27 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  29.83 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  29.62 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  27.45 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>