22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2180 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2180  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  39.19 
 
 
313 aa  95.9  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  31.54 
 
 
361 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 
589 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.17 
 
 
1842 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  46.88 
 
 
1882 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  31.71 
 
 
1052 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1992  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  38.68 
 
 
456 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  39.53 
 
 
290 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  30.1 
 
 
730 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  35.51 
 
 
203 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  33.33 
 
 
2495 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
399 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  34.75 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  32.79 
 
 
395 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  34.07 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  31.33 
 
 
254 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  30.88 
 
 
460 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  25.93 
 
 
1732 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  33.71 
 
 
231 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>