247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1704 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1320  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 315 aa  637    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.98777e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1704  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 315 aa  637    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.9221e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2280  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 315 aa  637    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.59311e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  24.38 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.25 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  24.81 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  22.3 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  23.77 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  21.11 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.54 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.85 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  24.54 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  23.32 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  22.93 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  25 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.38 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  26.7 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.06 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  20.22 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  22.81 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  22.81 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  25.57 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  22.14 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.77 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  24.11 
 
 		 291 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.53 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  23.94 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  27.31 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.84 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.81 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  22.8 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  21.92 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  20.52 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  21.55 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  20.88 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.41 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.88 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.99 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  24.72 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  20.38 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  20.75 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  20.38 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  22.93 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  23.45 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  23.59 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  23.72 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  26.01 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  24.52 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  22.94 
 
 		 498 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1744  integrase family protein  32.43 
 
 		 362 aa  49.3  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.05 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  19.77 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  24.31 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.16 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  22.93 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  26.12 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  22.43 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  21.72 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  23.26 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  21.48 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.47 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.05 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.06 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.06 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  22.43 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.88 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.48 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.06 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  31.11 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0669  integrase-recombinase  22.62 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  19.63 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  19.39 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.15 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.03 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.05 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  28.71 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  23.24 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.03 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  23.79 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.03 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.03 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.03 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  24.47 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>