More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0171 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0171  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 417 aa  825    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.07913e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  41.09 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  42.9 
 
 		 441 aa  266  5e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  38.78 
 
 		 438 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  38.74 
 
 		 436 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  40.16 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.56 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  39.89 
 
 		 442 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  39.89 
 
 		 442 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  40.16 
 
 		 442 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  41 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 439 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  40.16 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3015  Homoserine dehydrogenase  38.57 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00421083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  39.06 
 
 		 443 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  39.89 
 
 		 432 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.72 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.78 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  39.01 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  39.01 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  38.74 
 
 		 437 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  38.42 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  39.34 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 		 431 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  42.77 
 
 		 427 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.29 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  43 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  43 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  43 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  43 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  43 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  43 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  43 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  37.72 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  43.77 
 
 		 442 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  38.78 
 
 		 450 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  39.34 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  37.22 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  40.57 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  40.57 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  39.88 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  38.29 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  43.23 
 
 		 439 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  40.57 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.19 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 418 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  37.64 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.69 
 
 		 432 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0293  homoserine dehydrogenase  43.14 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  40.25 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  40.25 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  38.42 
 
 		 432 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  35.44 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  37.53 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  37.7 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  43.14 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  38.27 
 
 		 448 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  39.53 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  36.49 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.8 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.49 
 
 		 431 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 		 420 aa  232  9e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 		 429 aa  232  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  34.61 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>