95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5634 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5634  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0109  regulator protein FrmR  62.64 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6017  regulator protein FrmR  50.55 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6312  regulator protein FrmR  50.55 
 
 
91 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00311  regulator protein that represses frmRAB operon  47.25 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3268  regulator protein FrmR  47.25 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0382  regulator protein FrmR  47.25 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0388  regulator protein FrmR  47.25 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183191  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0422  regulator protein FrmR  47.25 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0272  regulator protein FrmR  47.25 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00315  hypothetical protein  47.25 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3249  protein of unknown function DUF156  47.25 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0145  hypothetical protein  47.25 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1178  protein of unknown function DUF156  48.57 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541287  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0131  hypothetical protein  44.68 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0126  hypothetical protein  44.68 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00761073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3388  protein of unknown function DUF156  41.76 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4093  hypothetical protein  43.94 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47420  hypothetical protein  43.94 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696075  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1959  hypothetical protein  39.56 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2799  hypothetical protein  39.56 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1742  putative cytoplasmic protein  39.56 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224779  normal  0.281419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1806  hypothetical protein  39.56 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1747  putative cytoplasmic protein  39.56 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.330539  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1529  putative cytoplasmic protein  39.56 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1714  hypothetical protein  39.56 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.0184205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2289  protein of unknown function DUF156  39.58 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4527  hypothetical protein  43.75 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118934  normal  0.237201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2130  hypothetical protein  44.07 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4323  hypothetical protein  39.68 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0084  protein of unknown function DUF156  36.96 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.702684  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1340  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.975436  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2231  hypothetical protein  41.27 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0066  protein of unknown function DUF156  35.87 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4424  hypothetical protein  42.42 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124641  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1127  hypothetical protein  37.31 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3299  protein of unknown function DUF156  41.38 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3563  hypothetical protein  38.24 
 
 
171 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0465  hypothetical protein  38.81 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06025  hypothetical protein  37.88 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03926  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0812275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3255  hypothetical protein  41.18 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0285545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3241  hypothetical protein  41.18 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0114048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3192  YohL  41.18 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3176  YohL  41.18 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3357  hypothetical protein  41.18 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0391  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1133  transcriptional repressor RcnR  38.24 
 
 
90 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0938  transcriptional repressor RcnR  38.24 
 
 
90 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.539838  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3088  transcriptional repressor RcnR  38.24 
 
 
90 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.203415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1542  hypothetical protein  38.24 
 
 
90 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1552  protein of unknown function DUF156  38.24 
 
 
90 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2393  transcriptional repressor RcnR  38.24 
 
 
90 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2241  transcriptional repressor RcnR  38.24 
 
 
90 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3352  hypothetical protein  39.39 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2855  hypothetical protein  35.09 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.458053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1089  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2846  protein containing  31.82 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2693  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3474  hypothetical protein  32.81 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5149  protein of unknown function DUF156  35.82 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0049  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1793  hypothetical protein  39.13 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270253  hitchhiker  0.00292517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0966  hypothetical protein  35.94 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2861  hypothetical protein  37.31 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1505  hypothetical protein  31.25 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258282  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3107  hypothetical protein  36.23 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5280  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3836  hypothetical protein  36.23 
 
 
90 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3942  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0569  protein of unknown function DUF156  35.82 
 
 
92 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0296  hypothetical protein  32.81 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02794  hypothetical protein  33.85 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1584  protein of unknown function DUF156  34.33 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.948708  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6501  protein of unknown function DUF156  34.29 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2529  hypothetical protein  32.86 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4111  hypothetical protein  30.3 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.9127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521198  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3405  hypothetical protein  30.3 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4762  hypothetical protein  30.3 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0400703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3401  hypothetical protein  32.86 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1678  protein of unknown function DUF156  34.33 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2938  protein of unknown function DUF156  34.33 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5055  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281346  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3200  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2538  protein of unknown function DUF156  34.33 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.840568  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3505  hypothetical protein  35.21 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal  0.637535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0853  protein of unknown function DUF156  37.68 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.509806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2350  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0979589  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3586  hypothetical protein  32.2 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0976  protein of unknown function DUF156  34.78 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.805178  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0756  hypothetical protein  34.21 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7457  hypothetical protein  32.84 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001364  hypothetical protein  60.71 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2648  hypothetical protein  32.39 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>