181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3877 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010578  Bind_3877  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
361 aa  735    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.86 
 
 
360 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
361 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.03 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.07 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.22 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.85 
 
 
516 aa  80.5  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.72 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.52 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  26.54 
 
 
781 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25.81 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  25.66 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.86 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.25 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.06 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.14 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.09 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.48 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  25.07 
 
 
779 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  27.92 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.86 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  25.34 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  25.54 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  26.93 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  25.07 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  25.07 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  24.31 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  24.38 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  27.36 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.5 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.5 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1220  glycosyl transferase family 9  26.78 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.42 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.42 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  24.5 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.42 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.42 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.42 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.38 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  25.69 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.42 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.42 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  25.82 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  24.54 
 
 
372 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.22 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.55 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.57 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.31 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  27.12 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  26.06 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.71 
 
 
361 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 
379 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  23.39 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  24.16 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  23.74 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.21 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.5 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.21 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  24.5 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  29.84 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  23.01 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  24.63 
 
 
356 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.42 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.29 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24 
 
 
345 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
390 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0634  glycosyl transferase family 9  23.16 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.25 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  22.88 
 
 
339 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0618  glycosyl transferase family 9  23.16 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  21.59 
 
 
409 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  23.94 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.61 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  23.78 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.49 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  25.07 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
330 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  36.27 
 
 
402 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  24.48 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  23.58 
 
 
357 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.28 
 
 
343 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  22.37 
 
 
327 aa  52.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000737815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.42 
 
 
352 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  22.35 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 
324 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>