31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3256 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3256  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1000    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0118  hypothetical protein  51.79 
 
 		 496 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3661  hypothetical protein  52.8 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.159613  normal  0.176734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2343  hypothetical protein  44.75 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.902991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1652  hypothetical protein  46.39 
 
 		 505 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1367  hypothetical protein  35.81 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0689  hypothetical protein  34.65 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0866657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2725  hypothetical protein  30.6 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2453  hypothetical protein  33.51 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1287  hypothetical protein  30.64 
 
 		 420 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.46065e-21 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3046  hypothetical protein  30 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2601  hypothetical protein  30.91 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000556017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2873  hypothetical protein  35.64 
 
 		 399 aa  98.6  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1045  hypothetical protein  32.78 
 
 		 416 aa  97.8  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2424  hypothetical protein  27.79 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3575  hypothetical protein  27.49 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2937  hypothetical protein  28.38 
 
 		 399 aa  94  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.336844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3009  hypothetical protein  28.12 
 
 		 418 aa  93.6  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0425000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1982  hypothetical protein  30.25 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000915947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1395  hypothetical protein  28.43 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0893  hypothetical protein  29.77 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2512  hypothetical protein  30.14 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1868  hypothetical protein  31.22 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1931  hypothetical protein  28.03 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.930432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2244  hypothetical protein  25.9 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.0297405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3141  hypothetical protein  29.17 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2662  hypothetical protein  29.17 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2170  hypothetical protein  29.17 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1938  hypothetical protein  29.17 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.915381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39000  hypothetical protein  26.56 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00275655  normal  0.388299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3321  hypothetical protein  26.56 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>