42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28020  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.83 
 
 		 491 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02734  glycerophosphodiester phosphodiesterase  25.61 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02535  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.12 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.36 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.28 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4126  glycerophosphodiester phosphodiesterase  38.55 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.04 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2174  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.09 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00147475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1882  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.93 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000161512  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.94 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5315  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.83 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  22.68 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.979822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01040  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.82 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1216  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.94 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30810  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.48 
 
 		 246 aa  45.8  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2347  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.35 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.02 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.03 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3758  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3985  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.28 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.77 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3613  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  48.15 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.33 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2228  hypothetical protein  34.95 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0972  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.83 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.701633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.93 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0885  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.48 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0088343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0543  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.5 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.77 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506569 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2200  hypothetical protein  34.95 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.66 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  46 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0230  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.29 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.8 
 
 		 631 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4097  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.58 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  31.87 
 
 		 594 aa  42.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5255  glycerophosphodiester phosphodiesterase  43.75 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.97 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2872  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.21 
 
 		 341 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3762  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.09 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0208318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2661  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.44 
 
 		 232 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.518214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>