106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09980  RNA-binding protein (KH domain)  100 
 
 		 80 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.4486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2539  hypothetical protein  69.74 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160005  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  70.13 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  65 
 
 		 81 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1399  hypothetical protein  68.83 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  70.13 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5925  hypothetical protein  65.82 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3259  hypothetical protein  64.94 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11050  RNA-binding protein (KH domain)  71.05 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506658  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1513  hypothetical protein  66.2 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1168  RNA-binding protein (KH domain)  75 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09760  hypothetical protein  62.03 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0801933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  65.75 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1471  KH domain protein  73.44 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0670497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3593  hypothetical protein  64.38 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23740  RNA-binding protein (KH domain)  71.88 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.860329  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1560  RNA-binding protein  64.79 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0831203 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  58.67 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  57.53 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2084  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  60 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0986  KH domain protein  73.77 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000116002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1618  hypothetical protein  56 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0250504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1195  hypothetical protein  64.29 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1828  KH domain protein  58.11 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0663  hypothetical protein  55.41 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.82455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1306  hypothetical protein  64.29 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3422  KH domain-containing protein  59.46 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0313217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  56.76 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  56.76 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  56.76 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  56.76 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  56.76 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12922  hypothetical protein  56.76 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.856852  normal  0.613221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0980  hypothetical protein  61.11 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.747535  normal  0.258716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3135  KH domain-containing protein  58.11 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0225  hypothetical protein  57.53 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2182  KH domain-containing protein  52.86 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1802  hypothetical protein  45.76 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.116861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  44.26 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2308  hypothetical protein  43.75 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  44.26 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  44.26 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  41.67 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  33.77 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  44.07 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  39.73 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2886  hypothetical protein  44.07 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  35.44 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2024  hypothetical protein  45.76 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000350692  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  39.19 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  38.36 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  42.86 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  44.07 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1098  hypothetical protein  47.54 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  44.12 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  34.72 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  34.72 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  40.62 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  39.06 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2277  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0054158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  42.37 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  42.62 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  37.5 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  40 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1484  hypothetical protein  46.38 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00652286  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1804  RNA-binding protein  31.25 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000242663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2673  RNA-binding protein  38.57 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0307943  hitchhiker  0.000000249091 
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  32.89 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  38.36 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  38.36 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  40.68 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  42.86 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  31.43 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  34.29 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3762  KH domain-containing protein  37.5 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1225  RNA-binding protein  36.23 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000401296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1288  RNA-binding protein  40 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1230  RNA-binding protein  36.23 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000705626  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0298  hypothetical protein  35.38 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000067955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2484  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1416  KH type 2 domain protein  40.32 
 
 		 88 aa  48.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000861561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3681  hypothetical protein  50.67 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.989233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  38.03 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1665  RNA-binding protein  40 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00331015  hitchhiker  0.0035897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  48.15 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00320  RNA-binding protein (KH domain)  45.45 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  32.84 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1964  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0657  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000412714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1942  hypothetical protein  51.92 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  40.35 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0647  RNA-binding protein  30.16 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.534792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0321  RNA-binding protein  25.86 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000789402  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1536  hypothetical protein  41.07 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000921217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  39.13 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>