More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5129 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5129  50S ribosomal protein L31 type B  100 
 
 
81 aa  169  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000037521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5498  50S ribosomal protein L31 type B  96.3 
 
 
81 aa  165  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000131175  unclonable  2.48072e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5180  50S ribosomal protein L31 type B  93.83 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00675998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5015  50S ribosomal protein L31 type B  93.83 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.65969e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5031  50S ribosomal protein L31 type B  93.83 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000768356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5423  50S ribosomal protein L31 type B  93.83 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.27581e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5574  50S ribosomal protein L31 type B  93.83 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5454  50S ribosomal protein L31 type B  93.83 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3852  50S ribosomal protein L31 type B  92.59 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000664047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5458  50S ribosomal protein L31 type B  92.59 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5509  50S ribosomal protein L31 type B  92.59 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1703  50S ribosomal protein L31 type B  79.75 
 
 
81 aa  141  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000392946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1727  50S ribosomal protein L31 type B  75.31 
 
 
85 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2156  50S ribosomal protein L31 type B  72.84 
 
 
84 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.475244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2194  50S ribosomal protein L31 type B  72.84 
 
 
84 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0620281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0233  50S ribosomal protein L31 type B  71.6 
 
 
81 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000024812  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0536  50S ribosomal protein L31 type B  75.31 
 
 
86 aa  131  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000345186  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0787  50S ribosomal protein L31 type B  76.54 
 
 
80 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0263  50S ribosomal protein L31 type B  67.5 
 
 
83 aa  121  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1784  50S ribosomal protein L31P  62.5 
 
 
80 aa  111  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000581965  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0758  hypothetical protein  58.97 
 
 
82 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3254  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 
80 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2751  50S ribosomal protein L31 type B  56.25 
 
 
84 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.178212  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1878  50S ribosomal protein L31 type B  58.97 
 
 
85 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2291  50S ribosomal protein L31P  56.25 
 
 
80 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000143826  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2250  50S ribosomal protein L31 type B  55 
 
 
87 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0614  ribosomal protein L31  57.5 
 
 
80 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02360  50S ribosomal protein L31 type B  56.96 
 
 
80 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2127  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 
85 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.029329  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1309  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
115 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7574  ribosomal protein L31  56.96 
 
 
81 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0637  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
115 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0786  50S ribosomal protein L31 type B  56.96 
 
 
80 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3270  ribosomal protein L31  55.7 
 
 
80 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0450  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 
88 aa  101  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000490006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0873  50S ribosomal protein L31 type B  55.7 
 
 
80 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00543783  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2901  50S ribosomal protein L31 type B  53.16 
 
 
87 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4370  ribosomal protein L31  53.85 
 
 
85 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.0154955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4415  ribosomal protein L31  58.23 
 
 
83 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000833435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1557  ribosomal protein L31  54.32 
 
 
82 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0965465  decreased coverage  0.00916576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0947  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal  0.576162 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5134  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
86 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593671  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36470  LSU ribosomal protein L31P  51.9 
 
 
105 aa  98.6  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6358  ribosomal protein L31  55.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1131  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1369  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00759194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2253  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.081991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2380  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2857  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2213  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248946  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0037  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1860  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2215  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477353  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1744  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372125  normal  0.163182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1771  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1440  50S ribosomal protein L31 type B  56.96 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219049  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1182  50S ribosomal protein L31 type B  51.85 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000836731  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6211  ribosomal protein L31  56.1 
 
 
83 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1820  50S ribosomal protein L31 type B  55.7 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0400323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2367  50S ribosomal protein L31 type B  55.7 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000177904  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03250  50S ribosomal protein L31 type B  50.63 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0402  50S ribosomal protein L31 type B  54.43 
 
 
85 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000944485  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6246  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1857  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316845  normal  0.0801388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0489  50S ribosomal protein L31P  53.85 
 
 
80 aa  95.9  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1833  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.012708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0234  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0913753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0526  ribosomal protein L31  58.75 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2137  50S ribosomal protein L31P  55.56 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171095  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0890  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1654  50S ribosomal protein L31P  59.15 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0125  ribosomal protein L31  53.01 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000012592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5333  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11640  LSU ribosomal protein L31P  51.28 
 
 
85 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1025  50S ribosomal protein L31 type B  54.32 
 
 
86 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.010082  normal  0.336183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1117  50S ribosomal protein L31 type B  54.32 
 
 
86 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0238519  normal  0.245393 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21720  LSU ribosomal protein L31P  55.7 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2120  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 
86 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002727  LSU ribosomal protein L31p  48.1 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0694209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04220  LSU ribosomal protein L31P  48.1 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2900  ribosomal protein L31  51.25 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2094  ribosomal protein L31  49.38 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00123067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1566  ribosomal protein L31  48.78 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2197  ribosomal protein L31  51.25 
 
 
97 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107823  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1470  ribosomal protein L31  50.63 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0295752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2807  ribosomal protein L31  48.81 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1281  50S ribosomal protein L31P  48.75 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2261  50S ribosomal protein L31P  48.75 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0923  ribosomal protein L31  51.28 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.587387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2635  50S ribosomal protein L31P  48.75 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00389942  normal  0.0577596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4909  ribosomal protein L31  51.22 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.665913  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3289  ribosomal protein L31  48.1 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0592  50S ribosomal protein L31 type B  52.5 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1495  ribosomal protein L31  51.25 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2363  50S ribosomal protein L31P  51.25 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0169896  normal  0.930447 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11228  50S ribosomal protein L31  51.25 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4797  ribosomal protein L31  51.25 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168745  normal  0.0677805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3920  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348577  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1916  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000248892  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2207  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 
93 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240279  normal  0.0216072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>