32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7213 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7213  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6384  hypothetical protein  82.68 
 
 
179 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.272426 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5875  hypothetical protein  79.89 
 
 
179 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5511  hypothetical protein  79.89 
 
 
179 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2933  hypothetical protein  57.26 
 
 
129 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706897  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4301  fucose-binding lectin II  58.2 
 
 
129 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4982  hypothetical protein  58.2 
 
 
129 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3178  fucose-binding lectin II  58.2 
 
 
129 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3259  fucose-binding lectin II  55.65 
 
 
129 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0014787  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2935  hypothetical protein  40.14 
 
 
309 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7212  hypothetical protein  34.78 
 
 
167 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.678924  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6383  hypothetical protein  34.16 
 
 
167 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138397  normal  0.269934 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5874  hypothetical protein  34.16 
 
 
167 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5510  hypothetical protein  34.16 
 
 
167 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311997  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3258  fucose-binding lectin II  42.24 
 
 
245 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000492866  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5108  fucose-binding lectin II  41.38 
 
 
245 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00609809  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2934  hypothetical protein  42.24 
 
 
283 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4302  fucose-binding lectin II  42.24 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  0.0766274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3177  fucose-binding lectin II  41.38 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0525996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4983  fucose-binding lectin II  41.38 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3288  hypothetical protein  36.28 
 
 
114 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0049  hypothetical protein  30.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1769  fucose-binding lectin PA-IIL  37.72 
 
 
115 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4984  fucose-binding lectin II  42.24 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3176  fucose-binding lectin II  42.24 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4303  fucose-binding lectin II  42.24 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.729545  normal  0.0282689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20610  fucose-binding lectin PA-IIL  36.84 
 
 
115 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000165307  normal  0.65706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0668  hypothetical protein  26.47 
 
 
174 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4715  hypothetical protein  24.05 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4089  hypothetical protein  24.54 
 
 
184 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3240  hypothetical protein  24.54 
 
 
184 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4277  hypothetical protein  24.54 
 
 
184 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>