179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1345 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1345  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  100 
 
 
115 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.686552  normal  0.339566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4399  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  98.26 
 
 
115 aa  233  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.027487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3935  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  97.39 
 
 
115 aa  233  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000726781  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3864  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  97.39 
 
 
114 aa  227  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00289311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4505  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  97.39 
 
 
114 aa  227  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5798  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  97.39 
 
 
114 aa  227  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.604474  normal  0.578121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4148  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  89.57 
 
 
114 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408824  normal  0.06885 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5660  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  76.32 
 
 
115 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1085  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  80.56 
 
 
116 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784995  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0242  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  80.56 
 
 
116 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0081  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  80.56 
 
 
116 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0339  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  80.56 
 
 
116 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0484824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1753  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  80.56 
 
 
116 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1664  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  80.56 
 
 
116 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963419  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1248  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  80.56 
 
 
116 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1171  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  75.44 
 
 
117 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1984  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  76.32 
 
 
117 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.288569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2213  putative ferredoxin subunit of nitrate/nitrite reductase (NADPH)  72.5 
 
 
123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4861  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  70 
 
 
127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366071  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4165  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  71.03 
 
 
112 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4277  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  71.03 
 
 
112 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.42444 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1221  nitrite reductase NADPH small subunit  70.75 
 
 
113 aa  156  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.194691  normal  0.590644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4819  nitrite reductase small subunit  66.06 
 
 
133 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0378332  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0177  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  65.14 
 
 
121 aa  150  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2003  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  60.75 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2392  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  57.01 
 
 
116 aa  120  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0318  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  51.85 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0795  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  52.34 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000069  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  54.13 
 
 
107 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3716  nitrite reductase small subunit  51.85 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3715  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  48.15 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0234  nitrite reductase small subunit  51.85 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3957  nitrite reductase small subunit  51.85 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3870  nitrite reductase small subunit  52.83 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2533  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  47.66 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4047  nitrite reductase small subunit  50.94 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3673  nitrite reductase small subunit  50.96 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4596  nitrite reductase small subunit  52.34 
 
 
108 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3746  nitrite reductase small subunit  50.96 
 
 
108 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  0.253474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3844  nitrite reductase small subunit  50 
 
 
108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1023  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  43.93 
 
 
110 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3781  nitrite reductase small subunit  50 
 
 
108 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3673  nitrite reductase small subunit  50 
 
 
108 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73177  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03659  putative nitrate reductase (electron transfer subunit) AND putative nitrite reductase (small subunit)  49.06 
 
 
123 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3794  nitrite reductase small subunit  50.96 
 
 
108 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1306  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  48.54 
 
 
124 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03217  nitrite reductase small subunit  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0346  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03169  hypothetical protein  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0346  nitrite reductase small subunit  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3648  nitrite reductase small subunit  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3742  nitrite reductase small subunit  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4677  nitrite reductase small subunit  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.270964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3562  nitrite reductase small subunit  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3836  nitrite reductase small subunit  49.04 
 
 
108 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1158  putative nitrate reductase (electron transfer subunit) and putative nitrite reductase (small subunit)  44.76 
 
 
106 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.997382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3263  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  45.95 
 
 
128 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3100  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  47.66 
 
 
128 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.391289  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0797  nitrite reductase small subunit  48.65 
 
 
109 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2354  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  43.52 
 
 
109 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0568758  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2814  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  44.14 
 
 
111 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.685316  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4261  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  50.48 
 
 
111 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00870  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  45.45 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0353  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  47.22 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1970  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.25 
 
 
966 aa  97.1  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4946  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  38.05 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1318  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  50 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1261  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  43.93 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.0689522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1743  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  44.86 
 
 
148 aa  95.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05592  oxidoreductase  40.95 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1553  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  39.67 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3870  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  50.49 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.923364  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2411  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  47.42 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000111196  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000002  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  40.95 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5923  nitrite reductase (NAD(P)H)  45.28 
 
 
116 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115962  normal  0.0766633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32850  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  45.13 
 
 
120 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0489103  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10256  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit nirD  48.48 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0364257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1331  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  35.85 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1493  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  47.57 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571604  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1706  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  43 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0120172  normal  0.0874629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0298  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  43.64 
 
 
115 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1259  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  44.66 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.936456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.52 
 
 
1373 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4014  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  43 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0246  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  43.75 
 
 
98 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0386  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  42.2 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42.59 
 
 
1381 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6174  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  44.44 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1304  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  42.86 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000476905  normal  0.731095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1379  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  45.37 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.861198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0171  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  44.21 
 
 
122 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1812  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40 
 
 
126 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.775653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2057  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.11 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2721  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.74 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1510  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  38.53 
 
 
108 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5407  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.11 
 
 
117 aa  83.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347398  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4025  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.95 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.591303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0839  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  51.09 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000121321  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0269  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  43.12 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2764  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.19 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.140502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>