44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5057 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5057  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  294  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1501  hypothetical protein  94.34 
 
 
158 aa  225  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787419  normal  0.0723582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6319  hypothetical protein  94.44 
 
 
162 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1760  hypothetical protein  94.44 
 
 
162 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1773  hypothetical protein  94.44 
 
 
162 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0651  hypothetical protein  64.38 
 
 
156 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0281  hypothetical protein  59.38 
 
 
157 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0982  hypothetical protein  59.38 
 
 
157 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0009  hypothetical protein  59.38 
 
 
157 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2680  hypothetical protein  59.38 
 
 
157 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2396  hypothetical protein  59.38 
 
 
157 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.344878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0819  hypothetical protein  59.38 
 
 
157 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0823  hypothetical protein  58.75 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.253243  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6280  hypothetical protein  55.19 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4315  hypothetical protein  54.17 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2736  hypothetical protein  49.63 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.816191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2600  hypothetical protein  45.45 
 
 
186 aa  90.5  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.716222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14380  hypothetical protein  48.89 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0723712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1916  hypothetical protein  48.86 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.274823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1845  hypothetical protein  42.71 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3527  hypothetical protein  37.38 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0864  hypothetical protein  37.38 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3656  hypothetical protein  37.38 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0994  hypothetical protein  39.72 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2754  P-18 protein  37.07 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0489  P-18 protein  33.79 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0503  hypothetical protein  38.71 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1239  hypothetical protein  34.15 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0492  hypothetical protein  39.16 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.702213  normal  0.0712002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4897  hypothetical protein  31.51 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4950  hypothetical protein  31.51 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4863  hypothetical protein  31.51 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4956  hypothetical protein  31.51 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0515  hypothetical protein  33 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4796  hypothetical protein  32.08 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.608299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04237  hypothetical protein  27.56 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00255693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3695  hypothetical protein  28.68 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000118901  hitchhiker  0.00917885 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04203  hypothetical protein  27.56 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3637  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000262647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4592  hypothetical protein  28.68 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000005798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4953  hypothetical protein  28.68 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000310111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4900  hypothetical protein  28.68 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5873  hypothetical protein  27.94 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.002117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4905  hypothetical protein  30.61 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000354937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>