More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6534 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
521 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432254  normal  0.0511942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.17 
 
 
521 aa  893    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000360253  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.14 
 
 
520 aa  842    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.23 
 
 
521 aa  1020    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.52 
 
 
520 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.654315 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.23 
 
 
521 aa  1020    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.877562  normal  0.90264 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.64 
 
 
521 aa  811    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467964  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.85 
 
 
516 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.86 
 
 
550 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.29 
 
 
549 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 
549 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.75 
 
 
547 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.59 
 
 
515 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 
515 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.13 
 
 
522 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.13 
 
 
522 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.02 
 
 
539 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60428  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 
529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
567 aa  323  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.86 
 
 
575 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 
567 aa  316  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
615 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
615 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 
617 aa  316  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  44.64 
 
 
608 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  44.91 
 
 
513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.97 
 
 
513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  44.8 
 
 
524 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
618 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.61 
 
 
597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  53.26 
 
 
600 aa  310  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.05 
 
 
601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.16 
 
 
562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 
538 aa  307  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.8 
 
 
673 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.8 
 
 
673 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 
572 aa  306  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.8 
 
 
673 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.8 
 
 
673 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.8 
 
 
673 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  42.8 
 
 
673 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.8 
 
 
671 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 
648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  43.38 
 
 
666 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 
538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.69 
 
 
552 aa  303  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.66 
 
 
566 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.46 
 
 
648 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.79 
 
 
578 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.41 
 
 
519 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.77 
 
 
580 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
605 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
508 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
584 aa  300  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
562 aa  299  9e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
523 aa  299  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 
583 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.69 
 
 
569 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  47.32 
 
 
536 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.68 
 
 
655 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 
539 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  47.32 
 
 
536 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  42.77 
 
 
515 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 
570 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.28 
 
 
608 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.28 
 
 
608 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.49 
 
 
588 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.12 
 
 
585 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 
519 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.97 
 
 
579 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  40.31 
 
 
533 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 
587 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  54.97 
 
 
579 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.89 
 
 
659 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.5 
 
 
524 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.23 
 
 
519 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
519 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27970  chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 
575 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0997024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.95 
 
 
653 aa  293  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  59.23 
 
 
585 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.95 
 
 
653 aa  293  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.83 
 
 
521 aa  292  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 
575 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.52 
 
 
553 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 
535 aa  292  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.27 
 
 
519 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.87 
 
 
570 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
519 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
519 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.76 
 
 
653 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0240769  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.46 
 
 
573 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22826  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0335  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.12 
 
 
394 aa  291  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.809135  normal  0.684623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  44.17 
 
 
546 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
546 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  44.17 
 
 
546 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4195  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
515 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  50.79 
 
 
513 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  44.17 
 
 
546 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.08 
 
 
622 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>