More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4321 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4321  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
452 aa  911    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3241  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  92.04 
 
 
452 aa  807    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.621427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2984  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  95.35 
 
 
452 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5248  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  88.94 
 
 
452 aa  790    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5003  NADH dehydrogenase  98.45 
 
 
452 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  92.7 
 
 
452 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5857  NADH dehydrogenase  98.45 
 
 
452 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1828  NADH dehydrogenase  55.11 
 
 
450 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  hitchhiker  0.00233776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2958  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.68 
 
 
462 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1512  NADH dehydrogenase  52.73 
 
 
445 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2041  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.41 
 
 
444 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0563919  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2434  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.8 
 
 
444 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2229  NADH dehydrogenase, membrane flavoprotein FAD NAD ubiquinone electron transport oxidoreductase  50.68 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0874  NADH dehydrogenase  48.63 
 
 
444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2623  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.51 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154931  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0320  NADH dehydrogenase  46.07 
 
 
460 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0850  NADH dehydrogenase  46.07 
 
 
460 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2402  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.07 
 
 
460 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0606  NADH dehydrogenase  45.45 
 
 
460 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.436779  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2545  NADH dehydrogenase  46.07 
 
 
460 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1697  NADH dehydrogenase  46.07 
 
 
460 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0354  NADH dehydrogenase  46.07 
 
 
460 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1501  NADH dehydrogenase  46.07 
 
 
460 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743235  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4826  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.87 
 
 
444 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0239032  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4420  NADH dehydrogenase  46.1 
 
 
448 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0675814  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2217  NADH dehydrogenase  45.94 
 
 
463 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540437  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2833  putative NADH dehydrogenase  45.19 
 
 
449 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4492  NADH dehydrogenase  45.94 
 
 
444 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3873  NADH dehydrogenase  45.94 
 
 
444 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6787  NADH dehydrogenase  46.33 
 
 
449 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000879358  hitchhiker  0.00000494045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3654  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.94 
 
 
444 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141344  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3244  NADH dehydrogenase  44.78 
 
 
444 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  0.0259001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3770  NADH dehydrogenase  44.78 
 
 
444 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563923  normal  0.0226708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2168  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.92 
 
 
456 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  0.677345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3718  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.18 
 
 
444 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4544  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.37 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.939793  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4539  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.45 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2866  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.07 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2640  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.07 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2763  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.84 
 
 
443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4267  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.88 
 
 
452 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.22 
 
 
432 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231283  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4164  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.39 
 
 
437 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5174  NADH dehydrogenase  44.67 
 
 
435 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58870  NADH dehydrogenase  44.44 
 
 
435 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0525175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0626  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.81 
 
 
431 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.5 
 
 
433 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.81 
 
 
431 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2325  NADH dehydrogenase  44.62 
 
 
432 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.84 
 
 
437 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.618936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0790  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.48 
 
 
432 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.58 
 
 
431 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5340  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0917  NADH dehydrogenase  43.48 
 
 
432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.52 
 
 
444 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.364819  hitchhiker  0.000890266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3680  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.27 
 
 
443 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4838  NADH dehydrogenase  43.59 
 
 
431 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41 
 
 
465 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01105  respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase  41.82 
 
 
434 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2538  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.82 
 
 
434 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0764017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1232  NADH dehydrogenase  41.82 
 
 
434 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1231  NADH dehydrogenase  41.82 
 
 
434 aa  323  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2492  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.82 
 
 
434 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000379984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1294  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.22 
 
 
436 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2017  NADH dehydrogenase  41.82 
 
 
434 aa  322  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000943189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2220  NADH dehydrogenase  40.55 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2214  NADH dehydrogenase  41.59 
 
 
434 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1310  NADH dehydrogenase  41.36 
 
 
434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000027785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2158  NADH dehydrogenase  41.36 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000756944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1325  NADH dehydrogenase  41.36 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  hitchhiker  0.00000413212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1974  NADH dehydrogenase  41.36 
 
 
434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1287  NADH dehydrogenase  41.36 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.174248  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1489  NADH dehydrogenase  41.59 
 
 
434 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1624  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.55 
 
 
434 aa  312  5.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.544426  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1985  fused respiratory FAD-dependent NADH dehydrogenase and cupric reductase  41.1 
 
 
428 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.13803  normal  0.853629 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1480  NADH dehydrogenase  39.29 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.538413  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0991  NADH dehydrogenase  40.31 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12000  uncoupled NADH:quinone oxidoreductase  41.04 
 
 
432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1926  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.6 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.886684  hitchhiker  0.0000426907 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003997  NADH dehydrogenase  38.24 
 
 
429 aa  298  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1918  NADH dehydrogenase  40.96 
 
 
440 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3455  NADH dehydrogenase  43.15 
 
 
440 aa  297  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0140  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.12 
 
 
436 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.6 
 
 
434 aa  296  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3414  NADH dehydrogenase  37.95 
 
 
433 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1594  NADH dehydrogenase  39.06 
 
 
434 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1702  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.06 
 
 
434 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2820  NADH dehydrogenase  39.06 
 
 
434 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667715  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1161  NADH dehydrogenase  39 
 
 
433 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00528742 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1311  NADH dehydrogenase  38.58 
 
 
429 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01525  NADH dehydrogenase  37.53 
 
 
429 aa  292  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1253  NADH dehydrogenase  36.49 
 
 
433 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.674072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.18 
 
 
435 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2486  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.14 
 
 
434 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1148  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.61 
 
 
433 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1608  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
435 aa  289  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2098  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.07 
 
 
433 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000978799  normal  0.232961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03829  Respiratory NADH dehydrogenase II  38.22 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1242  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.33 
 
 
432 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1280  NADH dehydrogenase  41.46 
 
 
432 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>