More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1423 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0417  putative methyl-accepting chemotaxis protein  75.18 
 
 		 558 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0931  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  75.18 
 
 		 653 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 557 aa  1078    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.02 
 
 		 558 aa  833    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1850  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  75.36 
 
 		 653 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.13 
 
 		 573 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22826  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4589  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.68 
 
 		 557 aa  880    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1696  methyl-accepting chemotaxis protein  75.45 
 
 		 647 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0745582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2629  methyl-accepting chemotaxis protein  75.99 
 
 		 558 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.57 
 
 		 562 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.36 
 
 		 558 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0745  putative methyl-accepting chemotaxis protein  75.18 
 
 		 558 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0963  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.46 
 
 		 557 aa  1072    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0423677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1327  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.84 
 
 		 558 aa  831    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.4 
 
 		 553 aa  724    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.64 
 
 		 557 aa  1073    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1464  putative methyl-accepting chemotaxis protein  75.18 
 
 		 558 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1674  methyl-accepting chemotaxis protein  75.18 
 
 		 647 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3683  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 		 613 aa  402  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.755698  normal  0.0578518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.42 
 
 		 634 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4163  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.42 
 
 		 634 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.72 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  63.72 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 		 579 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.71 
 
 		 521 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  65.26 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397554  normal  0.945455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.26 
 
 		 515 aa  350  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.01 
 
 		 611 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.09 
 
 		 521 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.657214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.98 
 
 		 532 aa  347  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.310324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.49 
 
 		 519 aa  346  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6164  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.39 
 
 		 544 aa  346  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.01 
 
 		 627 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191348  normal  0.480006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0438  methyl-accepting chemotaxis protein  63.11 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.5 
 
 		 598 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0469  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.78 
 
 		 549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.2 
 
 		 545 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.2 
 
 		 545 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.2 
 
 		 545 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02605  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  67.54 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414906  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0502  methyl-accepting chemotaxis protein  63 
 
 		 546 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 		 576 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448898  normal  0.153923 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  63 
 
 		 546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2799  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  62.54 
 
 		 515 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00825356  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3184  methyl-accepting chemotaxis protein  63 
 
 		 511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0685  methyl-accepting chemotaxis protein  63 
 
 		 526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  63 
 
 		 546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  63 
 
 		 546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  63 
 
 		 546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.82 
 
 		 573 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.23 
 
 		 584 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5547  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.4 
 
 		 520 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.02 
 
 		 579 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  57.89 
 
 		 585 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5592  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.44 
 
 		 567 aa  333  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.25 
 
 		 578 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.274613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6336  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.42 
 
 		 581 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.33 
 
 		 586 aa  330  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.9 
 
 		 615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.9 
 
 		 615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 		 535 aa  326  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.01 
 
 		 580 aa  325  9e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.21 
 
 		 578 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.91 
 
 		 608 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.91 
 
 		 608 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.19 
 
 		 517 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.679068  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.29 
 
 		 525 aa  323  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 532 aa  323  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.08 
 
 		 589 aa  323  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  60.9 
 
 		 559 aa  323  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.11 
 
 		 525 aa  322  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.62 
 
 		 579 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.07 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.36 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  62.85 
 
 		 752 aa  321  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.42 
 
 		 518 aa  320  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.26 
 
 		 566 aa  320  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.12 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.28 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3412  putative methyl-accepting chemotaxis I (serine chemoreceptor) transmembrane protein  58.33 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  54.01 
 
 		 636 aa  317  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2784  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.77 
 
 		 542 aa  317  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.7 
 
 		 661 aa  317  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  62.32 
 
 		 557 aa  316  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.34 
 
 		 556 aa  316  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.4 
 
 		 556 aa  316  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.32 
 
 		 557 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  53.35 
 
 		 667 aa  315  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  62.5 
 
 		 705 aa  316  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  62.32 
 
 		 557 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55 
 
 		 519 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4332  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 		 545 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.89 
 
 		 596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.28 
 
 		 589 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.32 
 
 		 519 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  61.36 
 
 		 618 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.51 
 
 		 651 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  63.67 
 
 		 600 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.72 
 
 		 554 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.547249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>