More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0548 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0548  type II secretion system protein E  100 
 
 		 424 aa  835    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000248612  normal  0.0592698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3663  type II secretion system protein E  93.16 
 
 		 425 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0506  type II secretion system protein E  89.59 
 
 		 414 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0103937  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0096  type II secretion system protein E  99.53 
 
 		 428 aa  831    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0481  type II secretion system protein E  90.8 
 
 		 414 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00626406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2818  type II secretion system protein E  89.9 
 
 		 455 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.016239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0578  type II secretion system protein E  99.53 
 
 		 428 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000399212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3506  type IV pilus biogenesis protein PilB  77.44 
 
 		 407 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2531  type II/IV secretion system protein  74.45 
 
 		 419 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3531  type IV pilus biogenesis protein PilB  77.18 
 
 		 407 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3527  type IV fimbrial biogenesis protein,PilB  74.45 
 
 		 419 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1311  type II/IV secretion system protein  76.67 
 
 		 407 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0453  type II/IV secretion system protein  76.92 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3251  type II/IV secretion system protein  76.67 
 
 		 407 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1136  type II/IV secretion system protein  72.68 
 
 		 423 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0504  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  68.72 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823394  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3452  type II secretion system protein E  68.41 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190294  hitchhiker  0.00352779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2655  type II secretion system protein E  64.62 
 
 		 432 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  51.05 
 
 		 573 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2825  type IV pilus assembly protein  51.37 
 
 		 575 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00509282  normal  0.0351792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2960  type II secretion system protein E  50.23 
 
 		 586 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.87 
 
 		 575 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.24 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3070  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.37 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.75 
 
 		 574 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  50.5 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.05 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  50.25 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  50.64 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  49.38 
 
 		 578 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.64 
 
 		 580 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.02 
 
 		 563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.13 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  49.87 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.35 
 
 		 568 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.23 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.98 
 
 		 555 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.1 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  49.61 
 
 		 568 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  50.87 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.3 
 
 		 565 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.87 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  50.77 
 
 		 577 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.23 
 
 		 577 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.59 
 
 		 568 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.59 
 
 		 568 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.81 
 
 		 568 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  49.35 
 
 		 568 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.1 
 
 		 568 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  49.1 
 
 		 569 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.02 
 
 		 578 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.13 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  51.15 
 
 		 571 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  48.1 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 568 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.13 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.71 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.47 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.87 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.37 
 
 		 571 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.91 
 
 		 569 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.61 
 
 		 577 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.91 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.49 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.17 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.69 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  48.06 
 
 		 569 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  48.83 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.91 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.83 
 
 		 577 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.38 
 
 		 569 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 569 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.55 
 
 		 569 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.58 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.83 
 
 		 577 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 570 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 570 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  47.64 
 
 		 569 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.68 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 570 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.04 
 
 		 566 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 570 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.7 
 
 		 572 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  46.17 
 
 		 591 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  49.21 
 
 		 562 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  46.67 
 
 		 571 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  45.94 
 
 		 573 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  45.92 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  48.87 
 
 		 553 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  48.09 
 
 		 571 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  46.72 
 
 		 570 aa  362  7.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  46.78 
 
 		 558 aa  362  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  44.96 
 
 		 561 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  47.91 
 
 		 561 aa  359  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  45.48 
 
 		 564 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  48.17 
 
 		 561 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  47.12 
 
 		 563 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  46.74 
 
 		 574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  46.21 
 
 		 574 aa  355  7.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>