25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4215 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4215  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.736535  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4151  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305018  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3365  hypothetical protein  98.91 
 
 
92 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203946  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1879  hypothetical protein  93.48 
 
 
91 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4040  hypothetical protein  91.3 
 
 
91 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.274742 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3559  hypothetical protein  91.3 
 
 
91 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828725  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4435  hypothetical protein  89.13 
 
 
91 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0775286  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1398  hypothetical protein  67.74 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111153  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1808  hypothetical protein  67.74 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1894  hypothetical protein  67.74 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0439  hypothetical protein  67.74 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0207  hypothetical protein  67.74 
 
 
90 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0943  hypothetical protein  67.74 
 
 
113 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1090  hypothetical protein  67.39 
 
 
187 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0355  hypothetical protein  67.74 
 
 
113 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3818  hypothetical protein  52.33 
 
 
93 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000402129  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0858  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3817  hypothetical protein  48.86 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1637  hypothetical protein  46.51 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00884  hypothetical protein  41.76 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.832169  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4716  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617114 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3639  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6740  hypothetical protein  43.62 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548647  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4999  hypothetical protein  48.15 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.457501  normal  0.0845037 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5404  hypothetical protein  48.15 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>