111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2828 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2828  major facilitator transporter  100 
 
 		 112 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  98.2 
 
 		 405 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  91.07 
 
 		 404 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  91.96 
 
 		 439 aa  191  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  91.07 
 
 		 404 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  83.64 
 
 		 451 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  85.45 
 
 		 403 aa  173  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  82.73 
 
 		 372 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  94.59 
 
 		 409 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  82.73 
 
 		 402 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  82.73 
 
 		 402 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  82.73 
 
 		 402 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  82.73 
 
 		 402 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  82.73 
 
 		 402 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  82.73 
 
 		 402 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  80 
 
 		 403 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  79.09 
 
 		 373 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  55.14 
 
 		 369 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  56.19 
 
 		 383 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  53.85 
 
 		 408 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 373 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  54.9 
 
 		 400 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  50 
 
 		 441 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 381 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 385 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  42.35 
 
 		 403 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 402 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1383  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  39.8 
 
 		 417 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  45.33 
 
 		 395 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 387 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 		 379 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 378 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 405 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  43.21 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  43.21 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  38.55 
 
 		 462 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 387 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 386 aa  53.9  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 390 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 405 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 388 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 398 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 396 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 392 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 400 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 391 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 384 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 386 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  34.48 
 
 		 383 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 384 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 384 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 384 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 384 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 379 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.72 
 
 		 384 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 389 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  39.33 
 
 		 414 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 389 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  39.76 
 
 		 403 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 377 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 389 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1120  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 396 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 411 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 385 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 397 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  36.36 
 
 		 377 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 396 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  36.96 
 
 		 428 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  42.35 
 
 		 392 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 419 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  37.5 
 
 		 379 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 382 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 		 396 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 386 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 400 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 421 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 388 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  34.91 
 
 		 377 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  34.85 
 
 		 397 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 435 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  35.23 
 
 		 352 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 386 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 397 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 408 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  33.96 
 
 		 378 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 383 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  33.96 
 
 		 378 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  33.96 
 
 		 378 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  34.44 
 
 		 401 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 401 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 385 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>