171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2364 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 267 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 267 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.6 
 
 		 247 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6327  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.33 
 
 		 247 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.5 
 
 		 247 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.69 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.83 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0521  hypothetical protein  70.78 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0292  hypothetical protein  70.78 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0342  hypothetical protein  70.78 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00283447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0329  hypothetical protein  70.78 
 
 		 293 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3383  hypothetical protein  70.78 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000331188  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3056  hypothetical protein  70.78 
 
 		 298 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.741857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2037  hypothetical protein  70.78 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2247  hypothetical protein  70.78 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  51.3 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  50.19 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  43.85 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 290 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  36.4 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  27.48 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  26.82 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  26.82 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  27.48 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.62 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.81 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.81 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1710  Dehydrogenase-like protein  30.28 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.2 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  31.58 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.3 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  23.46 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 254 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2412  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  28.52 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  22.81 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2677  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.09 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.457624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.44 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.39 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.184681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  22.43 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  26.69 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  30.27 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  29.96 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.13 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>