22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5711 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5148  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426334  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5711  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4528  hypothetical protein  98.7 
 
 
154 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151513  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3123  hypothetical protein  92.21 
 
 
154 aa  266  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4980  hypothetical protein  90.91 
 
 
154 aa  264  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411596  normal  0.591894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5314  hypothetical protein  89.61 
 
 
154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563959  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3169  hypothetical protein  93.51 
 
 
166 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0019  hypothetical protein  66.88 
 
 
177 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1165  hypothetical protein  66.88 
 
 
177 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1445  hypothetical protein  66.88 
 
 
177 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0021  hypothetical protein  66.88 
 
 
177 aa  189  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0019  hypothetical protein  66.88 
 
 
177 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0017  hypothetical protein  66.67 
 
 
135 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0015  hypothetical protein  65.93 
 
 
135 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1522  hypothetical protein  65.93 
 
 
135 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1573  putative signal peptide transmembrane protein  39.61 
 
 
154 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1774  putative signal peptide transmembrane protein  38.96 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2910  putative signal peptide transmembrane protein  39.61 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1345  hypothetical protein  30.32 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337158  normal  0.0274003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1409  hypothetical protein  29.63 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000519507  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5582  hypothetical protein  27.86 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5305  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>