More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4575 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3793  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4575  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5730  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1269  LysR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 291 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0299945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4068  LysR family transcriptional regulator  82.47 
 
 		 292 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  52.6 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  52.65 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6042  LysR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 302 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.957083 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5812  LysR family transcriptional regulator  52.49 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0538  LysR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1890  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2777  putative transcriptional regulator  37.19 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  34.05 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0673  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123933  decreased coverage  0.00380612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.07 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1230  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0006  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  34.29 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0006  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  35.46 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  30.47 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0014  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0243  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  31.92 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0368  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  33.33 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4131  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  31.03 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  34.92 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>