18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0390 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2717  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0390  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.996002  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0369  hypothetical protein  94.1 
 
 
288 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0309  hypothetical protein  62.89 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0318  hypothetical protein  60.96 
 
 
290 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.8352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0293  hypothetical protein  57.46 
 
 
285 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3026  hypothetical protein  36.69 
 
 
295 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3487  hypothetical protein  73.68 
 
 
118 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3760  hypothetical protein  35.82 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3702  hypothetical protein  35.71 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270649  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3731  hypothetical protein  35.71 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3204  hypothetical protein  35.46 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2749  hypothetical protein  35.46 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2799  hypothetical protein  35.46 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0357  hypothetical protein  32.32 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0548048 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1755  hypothetical protein  43.54 
 
 
153 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3600  hypothetical protein  30.71 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000146605  hitchhiker  0.0000000405528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2796  hypothetical protein  28.68 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>