17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0203 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0203  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0109  hypothetical protein  70.13 
 
 
305 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2728  hypothetical protein  74.13 
 
 
304 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0756893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3686  hypothetical protein  68.12 
 
 
310 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4744  hypothetical protein  67.42 
 
 
304 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111943  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2494  hypothetical protein  66.17 
 
 
333 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1182  hypothetical protein  64.66 
 
 
298 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.6386  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1658  hypothetical protein  62.88 
 
 
305 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0867  hypothetical protein  60.75 
 
 
303 aa  348  7e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0890858  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2357  hypothetical protein  57.29 
 
 
302 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0335886  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1619  hypothetical protein  60.38 
 
 
314 aa  346  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.175531  normal  0.0226832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2447  hypothetical protein  49.78 
 
 
363 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.938237 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4314  hypothetical protein  35.74 
 
 
427 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5360  hypothetical protein  36.44 
 
 
344 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5090  hypothetical protein  31 
 
 
423 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948231  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5048  hypothetical protein  31.18 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0131682  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1538  hypothetical protein  28.98 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292569  normal  0.943893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>